More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0005 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  58.74 
 
 		 804 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  58.74 
 
 		 804 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  58.7 
 
 		 804 aa  660    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  59.18 
 
 		 642 aa  758    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  62.61 
 
 		 795 aa  706    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  58.06 
 
 		 654 aa  753    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  57.77 
 
 		 638 aa  751    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  55.14 
 
 		 666 aa  694    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  71.16 
 
 		 643 aa  885    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  57.92 
 
 		 804 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  79.69 
 
 		 640 aa  1023    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  57.98 
 
 		 654 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  57.09 
 
 		 769 aa  646    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  66.41 
 
 		 650 aa  861    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  55.1 
 
 		 653 aa  690    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  58.81 
 
 		 655 aa  777    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  60.47 
 
 		 655 aa  780    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  79.53 
 
 		 640 aa  1024    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  57.98 
 
 		 654 aa  728    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  79.53 
 
 		 640 aa  1024    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  57.98 
 
 		 654 aa  728    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  58.2 
 
 		 635 aa  764    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl309  DNA topoisomerase IV subunit B  53.24 
 
 		 647 aa  659    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.747062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  79.38 
 
 		 640 aa  1022    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  57.98 
 
 		 654 aa  728    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  56.88 
 
 		 719 aa  706    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  58.93 
 
 		 805 aa  647    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  59.11 
 
 		 805 aa  648    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  55.17 
 
 		 675 aa  714    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  54.87 
 
 		 675 aa  709    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  61.18 
 
 		 661 aa  731    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  57.67 
 
 		 655 aa  761    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  64.98 
 
 		 633 aa  827    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  63.43 
 
 		 645 aa  770    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  56.53 
 
 		 651 aa  706    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  59.71 
 
 		 807 aa  660    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  60.68 
 
 		 795 aa  677    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  59.44 
 
 		 644 aa  760    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  59.6 
 
 		 655 aa  771    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  60.53 
 
 		 637 aa  768    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  60.16 
 
 		 655 aa  781    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  61.57 
 
 		 795 aa  702    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  59.75 
 
 		 797 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  57.52 
 
 		 655 aa  761    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  79.53 
 
 		 640 aa  1024    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  57.98 
 
 		 654 aa  728    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0003  DNA gyrase subunit B  58.2 
 
 		 769 aa  640    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  58.46 
 
 		 655 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  63.22 
 
 		 645 aa  766    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  57.05 
 
 		 634 aa  749    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0457  DNA topoisomerase IV, B subunit  52.37 
 
 		 643 aa  636    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.576082  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  70.25 
 
 		 640 aa  857    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  67.08 
 
 		 634 aa  867    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  67.4 
 
 		 638 aa  872    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0004  DNA gyrase subunit B  59.57 
 
 		 795 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  56.92 
 
 		 679 aa  664    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  54.02 
 
 		 675 aa  715    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  58.2 
 
 		 655 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  55.25 
 
 		 656 aa  706    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  59.53 
 
 		 805 aa  656    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  65.29 
 
 		 632 aa  854    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  62.96 
 
 		 645 aa  761    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  57.59 
 
 		 636 aa  746    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0008  DNA gyrase subunit B  59.25 
 
 		 879 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.938168  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0546  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.57 
 
 		 711 aa  655    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  54.87 
 
 		 675 aa  709    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  61.93 
 
 		 644 aa  827    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  59.11 
 
 		 806 aa  651    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  58.48 
 
 		 652 aa  750    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  67.34 
 
 		 638 aa  829    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  67.5 
 
 		 638 aa  830    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  59 
 
 		 807 aa  645    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  55.61 
 
 		 805 aa  658    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  64.41 
 
 		 633 aa  859    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  58.38 
 
 		 804 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  58.2 
 
 		 655 aa  746    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  66.61 
 
 		 651 aa  851    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  55.68 
 
 		 644 aa  701    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  64.84 
 
 		 652 aa  836    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  54.25 
 
 		 674 aa  655    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  65.62 
 
 		 655 aa  820    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  53.67 
 
 		 661 aa  676    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  63.31 
 
 		 672 aa  795    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  61.37 
 
 		 794 aa  694    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  54.72 
 
 		 649 aa  686    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  66.82 
 
 		 650 aa  857    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  55.32 
 
 		 696 aa  695    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  64.77 
 
 		 628 aa  868    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  60.96 
 
 		 808 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  59.21 
 
 		 812 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  58.08 
 
 		 666 aa  706    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  60.61 
 
 		 802 aa  688    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  59.91 
 
 		 643 aa  771    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  54.49 
 
 		 646 aa  705    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  54.87 
 
 		 675 aa  709    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  55.09 
 
 		 675 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  59.81 
 
 		 642 aa  759    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  59.68 
 
 		 798 aa  643    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  67.87 
 
 		 641 aa  857    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  57.09 
 
 		 769 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>