More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl006 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  51.17 
 
 		 645 aa  644    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  51.89 
 
 		 649 aa  658    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  53.15 
 
 		 640 aa  667    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  50.7 
 
 		 636 aa  638    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  55.82 
 
 		 640 aa  692    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  55.45 
 
 		 643 aa  680    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  55.5 
 
 		 640 aa  690    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  53.91 
 
 		 650 aa  657    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  52.92 
 
 		 640 aa  654    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  55.35 
 
 		 640 aa  690    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  58.2 
 
 		 640 aa  719    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  55.35 
 
 		 640 aa  690    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  50.24 
 
 		 637 aa  646    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  100 
 
 		 635 aa  1301    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  55.35 
 
 		 640 aa  690    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  55.66 
 
 		 640 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  58.49 
 
 		 640 aa  719    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  52.28 
 
 		 650 aa  652    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  49.26 
 
 		 675 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  53.54 
 
 		 633 aa  656    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  53.15 
 
 		 642 aa  647    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  54.66 
 
 		 633 aa  658    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  56.17 
 
 		 638 aa  672    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  54.91 
 
 		 644 aa  681    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  53.12 
 
 		 642 aa  654    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  50.31 
 
 		 644 aa  636    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  55.35 
 
 		 640 aa  690    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  50.55 
 
 		 636 aa  637    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  51.68 
 
 		 654 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  78.8 
 
 		 634 aa  1055    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  52.09 
 
 		 650 aa  665    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  51.83 
 
 		 634 aa  646    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  55.5 
 
 		 640 aa  687    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  56.29 
 
 		 649 aa  683    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  51.26 
 
 		 632 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  53.55 
 
 		 641 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  55.99 
 
 		 640 aa  674    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  50.55 
 
 		 644 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  55.99 
 
 		 640 aa  674    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  49.26 
 
 		 675 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  50.47 
 
 		 644 aa  655    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  51.52 
 
 		 657 aa  635    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  49.11 
 
 		 675 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  51.16 
 
 		 652 aa  646    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  54.52 
 
 		 627 aa  660    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.67 
 
 		 633 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  55.5 
 
 		 640 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  49.26 
 
 		 675 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  52.98 
 
 		 651 aa  642    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  52.99 
 
 		 652 aa  655    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  49.63 
 
 		 675 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  54.09 
 
 		 672 aa  645    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  55.35 
 
 		 640 aa  690    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  53.94 
 
 		 650 aa  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  53.44 
 
 		 647 aa  669    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  52.67 
 
 		 628 aa  688    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  52.43 
 
 		 633 aa  642    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  55.66 
 
 		 640 aa  692    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  50.87 
 
 		 655 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  49.33 
 
 		 714 aa  634  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  52.18 
 
 		 642 aa  631  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  51.89 
 
 		 650 aa  628  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  51.1 
 
 		 651 aa  630  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  49.6 
 
 		 636 aa  630  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  49.77 
 
 		 647 aa  628  1e-179  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  50 
 
 		 654 aa  627  1e-178  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  50.08 
 
 		 638 aa  625  1e-178  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  50.24 
 
 		 655 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  52.14 
 
 		 635 aa  627  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  50.62 
 
 		 648 aa  627  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  48.9 
 
 		 637 aa  625  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  50.54 
 
 		 648 aa  628  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  52.29 
 
 		 635 aa  625  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  51.5 
 
 		 642 aa  628  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  49.77 
 
 		 655 aa  623  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  49.61 
 
 		 637 aa  624  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  49.62 
 
 		 686 aa  622  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  52.6 
 
 		 637 aa  624  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  53.39 
 
 		 638 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  53.54 
 
 		 638 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  49.18 
 
 		 685 aa  620  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2996  DNA gyrase, B subunit  49.85 
 
 		 666 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  51.05 
 
 		 670 aa  620  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  49.33 
 
 		 660 aa  619  1e-176  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  48.55 
 
 		 656 aa  620  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  49.45 
 
 		 636 aa  621  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  49.37 
 
 		 649 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  50.16 
 
 		 642 aa  617  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  49.61 
 
 		 643 aa  617  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  48.99 
 
 		 646 aa  617  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  52.14 
 
 		 635 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  46.77 
 
 		 665 aa  618  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  53.24 
 
 		 655 aa  615  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  49.85 
 
 		 652 aa  614  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  50.16 
 
 		 642 aa  615  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  49.85 
 
 		 644 aa  613  9.999999999999999e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  49.55 
 
 		 695 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  49.63 
 
 		 696 aa  615  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  50.16 
 
 		 642 aa  614  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  49.37 
 
 		 643 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>