More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0041 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  54.17 
 
 
640 aa  662    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  52.8 
 
 
649 aa  662    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  51.34 
 
 
640 aa  644    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  54.26 
 
 
640 aa  660    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  54.1 
 
 
643 aa  671    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  54.8 
 
 
638 aa  659    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  53.94 
 
 
640 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  53.27 
 
 
650 aa  670    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  52.71 
 
 
650 aa  655    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  53.79 
 
 
640 aa  657    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  53.79 
 
 
640 aa  657    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  78.8 
 
 
635 aa  1055    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  53.94 
 
 
640 aa  658    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  54.26 
 
 
642 aa  658    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  53.79 
 
 
633 aa  655    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  52.75 
 
 
633 aa  652    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  49.77 
 
 
649 aa  638    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  51.63 
 
 
642 aa  648    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  54.65 
 
 
640 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  53.79 
 
 
640 aa  657    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  53.79 
 
 
640 aa  657    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  51.17 
 
 
648 aa  636    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  52.99 
 
 
644 aa  670    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  53.79 
 
 
640 aa  657    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 
634 aa  1303    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  54.33 
 
 
640 aa  659    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  51.78 
 
 
648 aa  643    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  53.07 
 
 
640 aa  678    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  51.57 
 
 
632 aa  650    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  50.95 
 
 
637 aa  641    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  51.18 
 
 
644 aa  658    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  51.71 
 
 
647 aa  655    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  54.65 
 
 
640 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  53 
 
 
641 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.49 
 
 
633 aa  645    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  52.43 
 
 
651 aa  644    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  52.28 
 
 
652 aa  654    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  57.05 
 
 
640 aa  704    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  52.04 
 
 
645 aa  647    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  56.58 
 
 
640 aa  691    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  51.99 
 
 
628 aa  679    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  51.79 
 
 
650 aa  659    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  53.7 
 
 
640 aa  651    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  52.28 
 
 
635 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  50.47 
 
 
637 aa  634  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  52.43 
 
 
672 aa  632  1e-180  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  50.23 
 
 
647 aa  633  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  51.65 
 
 
650 aa  632  1e-180  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  51.43 
 
 
633 aa  634  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  48.58 
 
 
636 aa  630  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  51.18 
 
 
634 aa  628  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  48.5 
 
 
675 aa  625  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  48.41 
 
 
656 aa  626  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  50.31 
 
 
643 aa  623  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  48.2 
 
 
675 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  48.13 
 
 
714 aa  624  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  48.2 
 
 
675 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  52.92 
 
 
627 aa  624  1e-177  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  48.99 
 
 
652 aa  624  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  48.87 
 
 
686 aa  625  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  48.2 
 
 
675 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  47.9 
 
 
675 aa  624  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  49.76 
 
 
638 aa  619  1e-176  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  49.45 
 
 
636 aa  620  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  50.71 
 
 
655 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  49.45 
 
 
636 aa  619  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  51.02 
 
 
655 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  50.16 
 
 
655 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  48.58 
 
 
685 aa  620  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  52.21 
 
 
637 aa  617  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  49.21 
 
 
637 aa  618  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  50.08 
 
 
655 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  46.14 
 
 
675 aa  615  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  50.86 
 
 
655 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  51.42 
 
 
635 aa  612  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  49.69 
 
 
661 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  45.97 
 
 
665 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  50.86 
 
 
642 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  47.65 
 
 
645 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  49.14 
 
 
655 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  47.34 
 
 
653 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  48.92 
 
 
654 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  49.69 
 
 
644 aa  613  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  48.42 
 
 
636 aa  611  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  49.48 
 
 
670 aa  608  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  48.07 
 
 
646 aa  609  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  53.06 
 
 
638 aa  609  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  52.9 
 
 
638 aa  608  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  49.14 
 
 
644 aa  610  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  50 
 
 
655 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  48.77 
 
 
719 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  47.43 
 
 
654 aa  607  9.999999999999999e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  49.53 
 
 
652 aa  606  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  50.95 
 
 
636 aa  607  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  49.54 
 
 
648 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  49.22 
 
 
651 aa  607  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  49.61 
 
 
643 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  50.31 
 
 
650 aa  602  1.0000000000000001e-171  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  50.93 
 
 
661 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  48.66 
 
 
655 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>