More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0782 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 674 aa  1379    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  66.46 
 
 		 666 aa  874    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  69.22 
 
 		 654 aa  942    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  66.77 
 
 		 653 aa  895    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  69.37 
 
 		 654 aa  943    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  69.37 
 
 		 654 aa  943    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl309  DNA topoisomerase IV subunit B  53.99 
 
 		 647 aa  691    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.747062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  69.37 
 
 		 654 aa  943    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  69.07 
 
 		 654 aa  934    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  69.22 
 
 		 654 aa  942    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  69.07 
 
 		 654 aa  932    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  54.49 
 
 		 642 aa  644    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  54.09 
 
 		 640 aa  673    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  65.05 
 
 		 665 aa  870    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  54.09 
 
 		 637 aa  637    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  51.4 
 
 		 637 aa  644    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  53.59 
 
 		 633 aa  635    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  70.11 
 
 		 645 aa  927    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  54.9 
 
 		 640 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  69.37 
 
 		 654 aa  943    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  69.37 
 
 		 654 aa  943    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  54.69 
 
 		 640 aa  643    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0457  DNA topoisomerase IV, B subunit  54.45 
 
 		 643 aa  686    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.576082  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  54.22 
 
 		 645 aa  646    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  65.05 
 
 		 663 aa  870    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  71.11 
 
 		 656 aa  935    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  53.52 
 
 		 644 aa  644    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  54.4 
 
 		 638 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  54.56 
 
 		 638 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  69.22 
 
 		 654 aa  941    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  68.6 
 
 		 644 aa  902    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  70.69 
 
 		 674 aa  919    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  71.38 
 
 		 661 aa  962    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1364  DNA topoisomerase IV subunit B  67.6 
 
 		 687 aa  903    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0683915  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  67.7 
 
 		 649 aa  887    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  52.13 
 
 		 628 aa  645    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 		 642 aa  641    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0523  DNA topoisomerase IV subunit B  52.35 
 
 		 642 aa  656    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  53.69 
 
 		 644 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  69.07 
 
 		 654 aa  939    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  53.55 
 
 		 648 aa  644    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf020  topoiosmerase IV subunit B  54.25 
 
 		 637 aa  680    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  52.87 
 
 		 641 aa  634  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  51.38 
 
 		 649 aa  634  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  51.98 
 
 		 632 aa  634  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  52.9 
 
 		 650 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  50.86 
 
 		 633 aa  633  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  52.67 
 
 		 638 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  51.98 
 
 		 637 aa  631  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  52.96 
 
 		 640 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  52.68 
 
 		 634 aa  627  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  52.8 
 
 		 640 aa  623  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  52.8 
 
 		 640 aa  623  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  52.8 
 
 		 640 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  52.8 
 
 		 640 aa  623  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  53.12 
 
 		 640 aa  624  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  52.8 
 
 		 640 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  51.48 
 
 		 636 aa  624  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  50.62 
 
 		 647 aa  622  1e-177  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  53.12 
 
 		 640 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  52.64 
 
 		 648 aa  622  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  52.96 
 
 		 640 aa  623  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  52.8 
 
 		 640 aa  623  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  52.35 
 
 		 640 aa  619  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  51.33 
 
 		 636 aa  621  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  52.11 
 
 		 649 aa  618  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  50.78 
 
 		 638 aa  618  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  52.44 
 
 		 633 aa  615  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  51.71 
 
 		 650 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  52.73 
 
 		 636 aa  613  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  51.11 
 
 		 633 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  51.93 
 
 		 651 aa  614  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  51.55 
 
 		 650 aa  615  9.999999999999999e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  49.84 
 
 		 636 aa  610  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  51.81 
 
 		 635 aa  608  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  51.73 
 
 		 640 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  50.86 
 
 		 652 aa  600  1e-170  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  51.4 
 
 		 642 aa  598  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  50.31 
 
 		 655 aa  596  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  47.95 
 
 		 675 aa  598  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  52.35 
 
 		 655 aa  595  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  48.85 
 
 		 654 aa  592  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  51.09 
 
 		 643 aa  595  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  51.16 
 
 		 642 aa  592  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  49.69 
 
 		 643 aa  592  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  50.31 
 
 		 643 aa  594  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  48.39 
 
 		 651 aa  589  1e-167  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  49.3 
 
 		 655 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  52.4 
 
 		 644 aa  592  1e-167  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  50 
 
 		 655 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  51.65 
 
 		 635 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  49.39 
 
 		 658 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  47.64 
 
 		 686 aa  589  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  50.7 
 
 		 635 aa  591  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  49.53 
 
 		 644 aa  589  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  48.71 
 
 		 665 aa  590  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  49.92 
 
 		 649 aa  588  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  48.39 
 
 		 652 aa  587  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  51.33 
 
 		 672 aa  587  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  49.69 
 
 		 643 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>