More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0005 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  54.14 
 
 		 640 aa  664    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  52.63 
 
 		 642 aa  673    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  53.98 
 
 		 640 aa  669    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  49.92 
 
 		 654 aa  639    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  64.59 
 
 		 685 aa  855    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  53.98 
 
 		 640 aa  669    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  53.39 
 
 		 643 aa  651    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  54.59 
 
 		 640 aa  671    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  67.02 
 
 		 649 aa  878    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  54.14 
 
 		 640 aa  669    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  52.69 
 
 		 637 aa  686    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  54.33 
 
 		 642 aa  674    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  50.07 
 
 		 643 aa  644    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  53.71 
 
 		 650 aa  643    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  53.86 
 
 		 640 aa  718    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 		 640 aa  643    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  53.98 
 
 		 640 aa  669    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  64.04 
 
 		 661 aa  883    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  53.98 
 
 		 640 aa  669    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  53.78 
 
 		 637 aa  644    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  53.12 
 
 		 647 aa  696    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  50.52 
 
 		 644 aa  659    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  54.29 
 
 		 640 aa  666    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00060  DNA gyrase subunit B  65.52 
 
 		 701 aa  882    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  72.87 
 
 		 695 aa  1003    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  66.62 
 
 		 661 aa  861    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  54.44 
 
 		 640 aa  669    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  64.26 
 
 		 657 aa  872    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0006  DNA gyrase subunit B  62.43 
 
 		 652 aa  781    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  55.2 
 
 		 633 aa  690    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  57.06 
 
 		 648 aa  716    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  50.3 
 
 		 644 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00100  DNA gyrase subunit B  70.91 
 
 		 711 aa  897    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  52.78 
 
 		 641 aa  677    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  53.06 
 
 		 647 aa  674    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  54.26 
 
 		 649 aa  707    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  53.59 
 
 		 645 aa  659    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  54.95 
 
 		 635 aa  698    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  51.72 
 
 		 642 aa  642    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  53.98 
 
 		 640 aa  669    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  62.61 
 
 		 654 aa  839    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  72.42 
 
 		 720 aa  994    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  73.95 
 
 		 685 aa  962    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  49.7 
 
 		 651 aa  635    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  56.37 
 
 		 648 aa  719    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 		 642 aa  635    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  54.74 
 
 		 634 aa  688    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  61.13 
 
 		 714 aa  858    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  62.3 
 
 		 679 aa  786    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  48.34 
 
 		 675 aa  661    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  51.26 
 
 		 645 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 686 aa  1419    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  53.86 
 
 		 632 aa  694    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  50.46 
 
 		 646 aa  650    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  52.34 
 
 		 650 aa  681    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  55.82 
 
 		 633 aa  709    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  56.78 
 
 		 645 aa  715    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  63.34 
 
 		 675 aa  842    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  55.29 
 
 		 644 aa  712    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  53.78 
 
 		 633 aa  678    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  56.88 
 
 		 640 aa  682    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  55.49 
 
 		 638 aa  670    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  55.22 
 
 		 641 aa  681    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  55.49 
 
 		 638 aa  671    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  62.95 
 
 		 719 aa  811    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  67.3 
 
 		 686 aa  884    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  62.74 
 
 		 675 aa  839    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  56.97 
 
 		 638 aa  683    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  54.83 
 
 		 640 aa  667    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  49.26 
 
 		 660 aa  641    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.48 
 
 		 633 aa  701    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  53.87 
 
 		 651 aa  652    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  52.04 
 
 		 635 aa  664    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  51.66 
 
 		 637 aa  670    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  56.58 
 
 		 640 aa  675    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  49.64 
 
 		 665 aa  649    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  55.27 
 
 		 636 aa  643    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  53.1 
 
 		 636 aa  682    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  54.48 
 
 		 642 aa  697    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  52.25 
 
 		 636 aa  664    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  54.73 
 
 		 650 aa  654    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  73.65 
 
 		 696 aa  1016    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  54.85 
 
 		 628 aa  719    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  63.39 
 
 		 648 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  51.03 
 
 		 656 aa  657    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  52.1 
 
 		 636 aa  663    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  66.82 
 
 		 666 aa  881    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  62.74 
 
 		 670 aa  799    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00060  DNA gyrase subunit B  81.69 
 
 		 683 aa  1135    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  50.75 
 
 		 643 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  61.05 
 
 		 711 aa  750    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 		 640 aa  643    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  63.34 
 
 		 675 aa  842    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  63.49 
 
 		 675 aa  840    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  48.5 
 
 		 659 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  56.61 
 
 		 644 aa  710    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  63.34 
 
 		 675 aa  842    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  66.31 
 
 		 696 aa  879    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  51.04 
 
 		 653 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  55.31 
 
 		 635 aa  660    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>