More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4578 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  61.75 
 
 		 647 aa  800    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1062  DNA topoisomerase IV subunit B  64.12 
 
 		 686 aa  818    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0407  DNA topoisomerase IV subunit B  60.45 
 
 		 663 aa  777    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  59.16 
 
 		 707 aa  767    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0749  DNA topoisomerase IV subunit B  56.86 
 
 		 654 aa  734    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120428  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0591  DNA topoisomerase IV subunit B  62.35 
 
 		 699 aa  814    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3980  DNA topoisomerase IV subunit B  60.12 
 
 		 687 aa  771    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  61.07 
 
 		 682 aa  808    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0425  DNA topoisomerase IV subunit B  60.62 
 
 		 698 aa  793    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.819354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  59.02 
 
 		 685 aa  798    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  58.54 
 
 		 683 aa  764    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0557  DNA topoisomerase IV subunit B  62.35 
 
 		 680 aa  815    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0772  DNA topoisomerase IV subunit B  60.9 
 
 		 663 aa  784    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4578  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 660 aa  1359    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.941273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  61.22 
 
 		 686 aa  788    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  60.59 
 
 		 679 aa  780    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2710  DNA topoisomerase IV subunit B  59.82 
 
 		 665 aa  793    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2978  DNA topoisomerase IV subunit B  59.97 
 
 		 684 aa  769    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  76.69 
 
 		 666 aa  1059    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0442115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1925  DNA topoisomerase IV subunit B  58.95 
 
 		 653 aa  766    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2827  DNA topoisomerase IV subunit B  60.31 
 
 		 685 aa  799    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2484  DNA topoisomerase IV subunit B  59.14 
 
 		 684 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1215  DNA topoisomerase IV subunit B  60.12 
 
 		 691 aa  771    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  59.27 
 
 		 683 aa  789    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2033  DNA topoisomerase IV subunit B  61.69 
 
 		 699 aa  789    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1740  DNA topoisomerase IV subunit B  59.85 
 
 		 669 aa  756    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00895559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1091  DNA topoisomerase IV subunit B  80.15 
 
 		 659 aa  1107    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1015  DNA topoisomerase IV subunit B  62.52 
 
 		 683 aa  818    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  60.38 
 
 		 678 aa  814    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  61.2 
 
 		 685 aa  795    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2226  DNA topoisomerase IV subunit B  62.22 
 
 		 702 aa  805    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2428  DNA topoisomerase IV subunit B  61.05 
 
 		 663 aa  785    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1328  DNA topoisomerase IV subunit B  58.59 
 
 		 672 aa  792    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.070173  normal  0.202878 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  61.31 
 
 		 704 aa  810    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0029  DNA topoisomerase IV subunit B  61.06 
 
 		 653 aa  780    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  59.71 
 
 		 678 aa  796    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0719  DNA topoisomerase IV subunit B  52.63 
 
 		 649 aa  638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  59.4 
 
 		 656 aa  766    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  61.83 
 
 		 704 aa  799    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0943361  normal  0.0152057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  62.27 
 
 		 684 aa  812    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0899  DNA topoisomerase IV subunit B  58.45 
 
 		 692 aa  781    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.712246  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  61.2 
 
 		 701 aa  794    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2134  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.01 
 
 		 647 aa  531  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.29 
 
 		 648 aa  524  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  44.33 
 
 		 644 aa  503  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0105  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.52 
 
 		 635 aa  499  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  44.24 
 
 		 640 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  43.08 
 
 		 637 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  42.11 
 
 		 634 aa  489  1e-137  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  42.88 
 
 		 635 aa  487  1e-136  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0599  DNA topoisomerase IV subunit B  45.37 
 
 		 630 aa  486  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  41.78 
 
 		 636 aa  483  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  41.85 
 
 		 636 aa  484  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  41.9 
 
 		 650 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  42.59 
 
 		 648 aa  477  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  41.71 
 
 		 640 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  43.06 
 
 		 645 aa  474  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3558  DNA topoisomerase IV subunit B  44.22 
 
 		 631 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236932  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  42.73 
 
 		 627 aa  473  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  42.12 
 
 		 641 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  42.86 
 
 		 648 aa  470  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2101  DNA topoisomerase IV, B subunit  44.14 
 
 		 628 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.846279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0820  DNA topoisomerase IV subunit B  45.24 
 
 		 628 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.676318  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00875  DNA topoisomerase IV subunit B  43.89 
 
 		 626 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0374  DNA topoisomerase IV subunit B  44.6 
 
 		 631 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  42.62 
 
 		 666 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  44.03 
 
 		 630 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  41.91 
 
 		 635 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4176  DNA topoisomerase IV subunit B  43.35 
 
 		 628 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.599957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  41.95 
 
 		 644 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0279  DNA topoisomerase IV subunit B  43.34 
 
 		 631 aa  465  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  44.03 
 
 		 630 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0746  DNA topoisomerase IV subunit B  43.36 
 
 		 626 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  44.03 
 
 		 630 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0727  DNA topoisomerase IV subunit B  43.52 
 
 		 626 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  42.38 
 
 		 645 aa  464  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4263  DNA topoisomerase IV subunit B  43.59 
 
 		 631 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00013039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3614  DNA topoisomerase IV subunit B  43.34 
 
 		 631 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4190  DNA topoisomerase IV subunit B  43.61 
 
 		 631 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0779  DNA topoisomerase IV subunit B  43.42 
 
 		 628 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.257119  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0578  DNA topoisomerase IV subunit B  43.34 
 
 		 631 aa  465  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0659  DNA topoisomerase IV subunit B  43.34 
 
 		 631 aa  465  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59712  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0730  DNA topoisomerase IV subunit B  43.27 
 
 		 628 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3043  DNA topoisomerase IV subunit B  42.9 
 
 		 628 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  44.03 
 
 		 630 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0670  DNA topoisomerase IV, B subunit  43.3 
 
 		 630 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4344  DNA topoisomerase IV subunit B  43.3 
 
 		 630 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0818  DNA topoisomerase IV subunit B  43.33 
 
 		 628 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3573  DNA topoisomerase IV subunit B  43.33 
 
 		 628 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3367  DNA topoisomerase IV subunit B  44.03 
 
 		 630 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3772  DNA topoisomerase IV subunit B  43.95 
 
 		 631 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0132  DNA topoisomerase IV subunit B  42.14 
 
 		 636 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000115849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0667  DNA topoisomerase IV subunit B  43.3 
 
 		 630 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.428879  decreased coverage  0.00919443 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.01 
 
 		 633 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  41.33 
 
 		 647 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3208  DNA topoisomerase IV subunit B  43.3 
 
 		 630 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  42.42 
 
 		 628 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3494  DNA topoisomerase IV subunit B  43.3 
 
 		 630 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02852  hypothetical protein  43.3 
 
 		 630 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  39.88 
 
 		 655 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>