More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2710 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1215  DNA topoisomerase IV subunit B  62.54 
 
 		 691 aa  806    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2428  DNA topoisomerase IV subunit B  59.88 
 
 		 663 aa  769    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  61.4 
 
 		 704 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0943361  normal  0.0152057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  61.16 
 
 		 707 aa  794    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  63.04 
 
 		 682 aa  814    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0425  DNA topoisomerase IV subunit B  62.84 
 
 		 698 aa  825    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.819354 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0591  DNA topoisomerase IV subunit B  62.67 
 
 		 699 aa  820    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1062  DNA topoisomerase IV subunit B  62.87 
 
 		 686 aa  799    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0557  DNA topoisomerase IV subunit B  62.67 
 
 		 680 aa  819    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0749  DNA topoisomerase IV subunit B  58.62 
 
 		 654 aa  751    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120428  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  64.25 
 
 		 679 aa  838    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2226  DNA topoisomerase IV subunit B  62.06 
 
 		 702 aa  779    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  62.98 
 
 		 685 aa  828    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  63.35 
 
 		 678 aa  831    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0772  DNA topoisomerase IV subunit B  59.88 
 
 		 663 aa  770    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117663  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  62.35 
 
 		 704 aa  820    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4578  DNA topoisomerase IV subunit B  59.82 
 
 		 660 aa  795    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.941273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  63.13 
 
 		 647 aa  810    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2710  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 665 aa  1358    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2978  DNA topoisomerase IV subunit B  61.45 
 
 		 684 aa  801    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  61.93 
 
 		 666 aa  804    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0442115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  61.78 
 
 		 683 aa  802    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1925  DNA topoisomerase IV subunit B  59.16 
 
 		 653 aa  762    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2827  DNA topoisomerase IV subunit B  63.82 
 
 		 685 aa  842    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0029  DNA topoisomerase IV subunit B  64.06 
 
 		 653 aa  828    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2484  DNA topoisomerase IV subunit B  62.98 
 
 		 684 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  62.8 
 
 		 683 aa  828    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1740  DNA topoisomerase IV subunit B  58.76 
 
 		 669 aa  752    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00895559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1091  DNA topoisomerase IV subunit B  62.71 
 
 		 659 aa  814    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1015  DNA topoisomerase IV subunit B  63.5 
 
 		 683 aa  842    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  63.47 
 
 		 686 aa  819    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  64.18 
 
 		 684 aa  828    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3980  DNA topoisomerase IV subunit B  61.6 
 
 		 687 aa  778    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1328  DNA topoisomerase IV subunit B  60.68 
 
 		 672 aa  825    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.070173  normal  0.202878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  63.59 
 
 		 701 aa  813    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  62.44 
 
 		 678 aa  801    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2033  DNA topoisomerase IV subunit B  61.2 
 
 		 699 aa  779    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0719  DNA topoisomerase IV subunit B  53.04 
 
 		 649 aa  653    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  60.48 
 
 		 656 aa  773    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0407  DNA topoisomerase IV subunit B  59.28 
 
 		 663 aa  763    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0899  DNA topoisomerase IV subunit B  60.55 
 
 		 692 aa  826    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.712246  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  63.44 
 
 		 685 aa  811    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2134  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.78 
 
 		 647 aa  528  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.88 
 
 		 648 aa  524  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  43.4 
 
 		 636 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  45.01 
 
 		 640 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  44.55 
 
 		 644 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  43.4 
 
 		 636 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  43.64 
 
 		 640 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  44.04 
 
 		 645 aa  506  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  44.19 
 
 		 635 aa  502  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.49 
 
 		 633 aa  503  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0105  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.14 
 
 		 635 aa  503  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  45.36 
 
 		 649 aa  500  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  44.33 
 
 		 645 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  43.11 
 
 		 653 aa  500  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  43.1 
 
 		 632 aa  499  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  41.94 
 
 		 634 aa  498  1e-139  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1753  DNA topoisomerase IV, B subunit  45.81 
 
 		 638 aa  498  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  42.86 
 
 		 635 aa  492  9.999999999999999e-139  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  43.16 
 
 		 650 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  43.54 
 
 		 628 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  42.51 
 
 		 648 aa  489  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  42.03 
 
 		 644 aa  490  1e-137  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  43.67 
 
 		 643 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  41.43 
 
 		 642 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  44.29 
 
 		 638 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  40.84 
 
 		 637 aa  486  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  42.94 
 
 		 644 aa  488  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  42.03 
 
 		 647 aa  483  1e-135  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  43.22 
 
 		 649 aa  482  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  43.49 
 
 		 642 aa  485  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  43.78 
 
 		 655 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  43.63 
 
 		 637 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  43.03 
 
 		 627 aa  483  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3325  DNA topoisomerase IV subunit B  43.89 
 
 		 630 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0947  DNA topoisomerase IV subunit B  43.36 
 
 		 630 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.798803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  42.79 
 
 		 643 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  42.62 
 
 		 644 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  42.69 
 
 		 655 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  43.29 
 
 		 655 aa  485  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02902  DNA topoisomerase IV subunit B  43.74 
 
 		 630 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0670  DNA topoisomerase IV, B subunit  43.74 
 
 		 630 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3463  DNA topoisomerase IV subunit B  43.74 
 
 		 630 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0667  DNA topoisomerase IV subunit B  43.74 
 
 		 630 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.428879  decreased coverage  0.00919443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3614  DNA topoisomerase IV subunit B  44.33 
 
 		 631 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  43.78 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  43.14 
 
 		 644 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  43.78 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  43.41 
 
 		 644 aa  479  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3772  DNA topoisomerase IV subunit B  44.17 
 
 		 631 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02852  hypothetical protein  43.74 
 
 		 630 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  43.5 
 
 		 641 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3494  DNA topoisomerase IV subunit B  43.74 
 
 		 630 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3208  DNA topoisomerase IV subunit B  43.74 
 
 		 630 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  43.78 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4344  DNA topoisomerase IV subunit B  43.74 
 
 		 630 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  43.78 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  42.19 
 
 		 654 aa  476  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2414  DNA topoisomerase IV subunit B  44.3 
 
 		 628 aa  478  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.752872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>