More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3119 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  85.15 
 
 		 684 aa  1202    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  99.71 
 
 		 685 aa  1392    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0029  DNA topoisomerase IV subunit B  61.3 
 
 		 653 aa  760    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0591  DNA topoisomerase IV subunit B  71.89 
 
 		 699 aa  947    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  85.44 
 
 		 682 aa  1204    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  63.99 
 
 		 707 aa  816    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4578  DNA topoisomerase IV subunit B  61.19 
 
 		 660 aa  798    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.941273 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0557  DNA topoisomerase IV subunit B  71.89 
 
 		 680 aa  947    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  68 
 
 		 704 aa  939    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  70.57 
 
 		 685 aa  982    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 701 aa  1426    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0772  DNA topoisomerase IV subunit B  63.09 
 
 		 663 aa  788    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117663  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  97.52 
 
 		 647 aa  1295    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  62.5 
 
 		 678 aa  802    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0749  DNA topoisomerase IV subunit B  62.29 
 
 		 654 aa  763    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120428  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2710  DNA topoisomerase IV subunit B  63.59 
 
 		 665 aa  811    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2978  DNA topoisomerase IV subunit B  69.57 
 
 		 684 aa  962    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  60.91 
 
 		 666 aa  790    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0442115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1925  DNA topoisomerase IV subunit B  59.29 
 
 		 653 aa  743    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2827  DNA topoisomerase IV subunit B  71.87 
 
 		 685 aa  967    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2484  DNA topoisomerase IV subunit B  70.57 
 
 		 684 aa  969    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  90.29 
 
 		 686 aa  1269    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  70.1 
 
 		 683 aa  979    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1062  DNA topoisomerase IV subunit B  72.04 
 
 		 686 aa  911    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1740  DNA topoisomerase IV subunit B  60.37 
 
 		 669 aa  741    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00895559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1091  DNA topoisomerase IV subunit B  61.38 
 
 		 659 aa  792    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1015  DNA topoisomerase IV subunit B  68.6 
 
 		 683 aa  936    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  73.88 
 
 		 678 aa  990    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  71.73 
 
 		 683 aa  950    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0425  DNA topoisomerase IV subunit B  71.82 
 
 		 698 aa  991    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.819354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1328  DNA topoisomerase IV subunit B  62.08 
 
 		 672 aa  825    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.070173  normal  0.202878 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2428  DNA topoisomerase IV subunit B  62.94 
 
 		 663 aa  787    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  69.91 
 
 		 704 aa  887    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0943361  normal  0.0152057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1215  DNA topoisomerase IV subunit B  69.85 
 
 		 691 aa  953    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3980  DNA topoisomerase IV subunit B  72.69 
 
 		 687 aa  943    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0719  DNA topoisomerase IV subunit B  53.55 
 
 		 649 aa  662    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  62.44 
 
 		 656 aa  786    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  69.15 
 
 		 679 aa  885    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0407  DNA topoisomerase IV subunit B  62.48 
 
 		 663 aa  785    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2226  DNA topoisomerase IV subunit B  70.12 
 
 		 702 aa  891    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0899  DNA topoisomerase IV subunit B  63.94 
 
 		 692 aa  884    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.712246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2033  DNA topoisomerase IV subunit B  70.23 
 
 		 699 aa  877    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.41 
 
 		 648 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2134  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.75 
 
 		 647 aa  520  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  45.03 
 
 		 644 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  45.06 
 
 		 636 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  44.91 
 
 		 636 aa  514  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  44.44 
 
 		 640 aa  514  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  44.72 
 
 		 650 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  44.27 
 
 		 640 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03685  DNA topoisomerase IV subunit B  46.89 
 
 		 631 aa  495  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0374  DNA topoisomerase IV subunit B  44.79 
 
 		 631 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2123  DNA topoisomerase IV subunit B  44.63 
 
 		 640 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.59022  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  44.24 
 
 		 655 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  45.09 
 
 		 655 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0105  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.6 
 
 		 635 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0820  DNA topoisomerase IV subunit B  44.17 
 
 		 628 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.676318  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2008  DNA topoisomerase IV subunit B  45.92 
 
 		 626 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000820641  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0746  DNA topoisomerase IV subunit B  43.72 
 
 		 626 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3772  DNA topoisomerase IV subunit B  44.22 
 
 		 631 aa  490  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00875  DNA topoisomerase IV subunit B  45.28 
 
 		 626 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0328  DNA topoisomerase IV subunit B  44.33 
 
 		 631 aa  491  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934863  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0435  DNA topoisomerase IV subunit B  44.19 
 
 		 629 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  43.61 
 
 		 635 aa  491  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2101  DNA topoisomerase IV, B subunit  44.25 
 
 		 628 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.846279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0730  DNA topoisomerase IV subunit B  44.66 
 
 		 628 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3614  DNA topoisomerase IV subunit B  44.09 
 
 		 631 aa  492  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  42.94 
 
 		 635 aa  488  1e-136  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0727  DNA topoisomerase IV subunit B  43.72 
 
 		 626 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3554  DNA topoisomerase IV subunit B  44.32 
 
 		 632 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2670  DNA topoisomerase IV subunit B  44.53 
 
 		 626 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0599  DNA topoisomerase IV subunit B  45.95 
 
 		 630 aa  486  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  43.79 
 
 		 655 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  43.1 
 
 		 647 aa  483  1e-135  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0319  DNA topoisomerase IV subunit B  43.65 
 
 		 631 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  43.43 
 
 		 655 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3367  DNA topoisomerase IV subunit B  43.46 
 
 		 630 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2094  DNA topoisomerase IV subunit B  43.46 
 
 		 628 aa  483  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.104639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  43.46 
 
 		 630 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  43.87 
 
 		 627 aa  484  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  44.94 
 
 		 655 aa  484  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  43.46 
 
 		 630 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0947  DNA topoisomerase IV subunit B  44 
 
 		 630 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.798803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  43.46 
 
 		 630 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  43.46 
 
 		 630 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  43.94 
 
 		 658 aa  485  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0670  DNA topoisomerase IV, B subunit  43.3 
 
 		 630 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4344  DNA topoisomerase IV subunit B  43.3 
 
 		 630 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  44.43 
 
 		 641 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3494  DNA topoisomerase IV subunit B  43.3 
 
 		 630 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3325  DNA topoisomerase IV subunit B  43.46 
 
 		 630 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707036 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  43.56 
 
 		 642 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  42.28 
 
 		 634 aa  481  1e-134  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  43.55 
 
 		 634 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0779  DNA topoisomerase IV subunit B  42.55 
 
 		 628 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.257119  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2414  DNA topoisomerase IV subunit B  43.3 
 
 		 628 aa  480  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.752872 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0578  DNA topoisomerase IV subunit B  43.41 
 
 		 631 aa  482  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0659  DNA topoisomerase IV subunit B  43.41 
 
 		 631 aa  482  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3208  DNA topoisomerase IV subunit B  43.3 
 
 		 630 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  44.91 
 
 		 638 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>