More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2173 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4578  DNA topoisomerase IV subunit B  60.15 
 
 		 660 aa  799    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.941273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0029  DNA topoisomerase IV subunit B  75.35 
 
 		 653 aa  980    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0591  DNA topoisomerase IV subunit B  59.85 
 
 		 699 aa  779    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  58.64 
 
 		 704 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0943361  normal  0.0152057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  59.09 
 
 		 683 aa  768    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  62.5 
 
 		 701 aa  803    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  61.46 
 
 		 682 aa  802    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  58.93 
 
 		 685 aa  786    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3980  DNA topoisomerase IV subunit B  59.29 
 
 		 687 aa  756    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0772  DNA topoisomerase IV subunit B  56.89 
 
 		 663 aa  740    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  61.43 
 
 		 686 aa  804    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0749  DNA topoisomerase IV subunit B  55.76 
 
 		 654 aa  719    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120428  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0557  DNA topoisomerase IV subunit B  59.85 
 
 		 680 aa  778    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  61.56 
 
 		 679 aa  791    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  59.54 
 
 		 707 aa  752    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2710  DNA topoisomerase IV subunit B  62.44 
 
 		 665 aa  800    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2978  DNA topoisomerase IV subunit B  57.96 
 
 		 684 aa  753    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  60.62 
 
 		 666 aa  780    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0442115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  62.35 
 
 		 685 aa  800    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1925  DNA topoisomerase IV subunit B  56.99 
 
 		 653 aa  727    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2827  DNA topoisomerase IV subunit B  58.62 
 
 		 685 aa  784    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 678 aa  1383    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2484  DNA topoisomerase IV subunit B  58.83 
 
 		 684 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0407  DNA topoisomerase IV subunit B  58.7 
 
 		 663 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  59.14 
 
 		 683 aa  788    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1740  DNA topoisomerase IV subunit B  57.45 
 
 		 669 aa  735    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00895559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1091  DNA topoisomerase IV subunit B  59.68 
 
 		 659 aa  784    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1015  DNA topoisomerase IV subunit B  59.71 
 
 		 683 aa  802    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2226  DNA topoisomerase IV subunit B  58.81 
 
 		 702 aa  750    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2033  DNA topoisomerase IV subunit B  58.58 
 
 		 699 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2428  DNA topoisomerase IV subunit B  56.74 
 
 		 663 aa  739    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  61.52 
 
 		 684 aa  805    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1328  DNA topoisomerase IV subunit B  59.12 
 
 		 672 aa  786    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.070173  normal  0.202878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1062  DNA topoisomerase IV subunit B  60.88 
 
 		 686 aa  764    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  63.01 
 
 		 647 aa  799    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  59.53 
 
 		 678 aa  768    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0719  DNA topoisomerase IV subunit B  52.76 
 
 		 649 aa  667    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0425  DNA topoisomerase IV subunit B  58.89 
 
 		 698 aa  782    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.819354 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  58.63 
 
 		 656 aa  740    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1215  DNA topoisomerase IV subunit B  59.28 
 
 		 691 aa  780    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0899  DNA topoisomerase IV subunit B  57.43 
 
 		 692 aa  768    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.712246  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  58.55 
 
 		 704 aa  770    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.63 
 
 		 648 aa  551  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2134  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.93 
 
 		 647 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0105  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  46.92 
 
 		 635 aa  525  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  44.15 
 
 		 640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  44.05 
 
 		 640 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  42.99 
 
 		 636 aa  509  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  43.05 
 
 		 644 aa  512  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  42.84 
 
 		 636 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  42.68 
 
 		 650 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  42.11 
 
 		 627 aa  499  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.69 
 
 		 633 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  43.38 
 
 		 635 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  43.93 
 
 		 641 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  43.14 
 
 		 628 aa  498  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  42.94 
 
 		 642 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  42.22 
 
 		 653 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  42.81 
 
 		 642 aa  495  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  43.03 
 
 		 633 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  42.64 
 
 		 645 aa  489  1e-137  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  43.19 
 
 		 642 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  42.38 
 
 		 645 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  41.19 
 
 		 635 aa  485  1e-135  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  42.51 
 
 		 660 aa  482  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  43.28 
 
 		 642 aa  479  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  40.67 
 
 		 634 aa  481  1e-134  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  42.08 
 
 		 644 aa  479  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0279  DNA topoisomerase IV subunit B  43.48 
 
 		 631 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0659  DNA topoisomerase IV subunit B  43.48 
 
 		 631 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59712  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2670  DNA topoisomerase IV subunit B  44.1 
 
 		 626 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00875  DNA topoisomerase IV subunit B  44.12 
 
 		 626 aa  478  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  41.47 
 
 		 633 aa  477  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  42.19 
 
 		 650 aa  477  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0578  DNA topoisomerase IV subunit B  43.48 
 
 		 631 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0599  DNA topoisomerase IV subunit B  42.79 
 
 		 630 aa  476  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  41.6 
 
 		 644 aa  477  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0947  DNA topoisomerase IV subunit B  44.92 
 
 		 630 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.798803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  43.27 
 
 		 638 aa  479  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0328  DNA topoisomerase IV subunit B  43.63 
 
 		 631 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934863  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  42.66 
 
 		 642 aa  472  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  40.87 
 
 		 636 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  41.82 
 
 		 634 aa  474  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  43.56 
 
 		 649 aa  475  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03685  DNA topoisomerase IV subunit B  44.13 
 
 		 631 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  43.98 
 
 		 640 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  42.81 
 
 		 642 aa  475  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  43.45 
 
 		 719 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3614  DNA topoisomerase IV subunit B  43.63 
 
 		 631 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  43.32 
 
 		 630 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  43.32 
 
 		 630 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  43.21 
 
 		 661 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0319  DNA topoisomerase IV subunit B  43.01 
 
 		 631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  43.32 
 
 		 630 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4263  DNA topoisomerase IV subunit B  43.39 
 
 		 631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00013039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  41.35 
 
 		 632 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  43.32 
 
 		 630 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  44.5 
 
 		 636 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3772  DNA topoisomerase IV subunit B  43.47 
 
 		 631 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2008  DNA topoisomerase IV subunit B  44.59 
 
 		 626 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000820641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>