More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0591 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1062  DNA topoisomerase IV subunit B  76.11 
 
 
686 aa  1073    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388156  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  71.89 
 
 
647 aa  942    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0557  DNA topoisomerase IV subunit B  99.85 
 
 
680 aa  1397    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  59.94 
 
 
678 aa  778    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2033  DNA topoisomerase IV subunit B  76.82 
 
 
699 aa  1074    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440623  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0591  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 
699 aa  1439    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1215  DNA topoisomerase IV subunit B  68.52 
 
 
691 aa  926    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  69.87 
 
 
682 aa  958    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  71.89 
 
 
701 aa  948    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0407  DNA topoisomerase IV subunit B  61.76 
 
 
663 aa  776    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0425  DNA topoisomerase IV subunit B  67.27 
 
 
698 aa  921    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.819354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  68.74 
 
 
685 aa  929    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  66.46 
 
 
707 aa  861    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0772  DNA topoisomerase IV subunit B  62.38 
 
 
663 aa  781    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117663  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0029  DNA topoisomerase IV subunit B  59.81 
 
 
653 aa  766    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3980  DNA topoisomerase IV subunit B  68.84 
 
 
687 aa  889    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2226  DNA topoisomerase IV subunit B  76.67 
 
 
702 aa  1087    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2710  DNA topoisomerase IV subunit B  62.71 
 
 
665 aa  817    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2978  DNA topoisomerase IV subunit B  66.23 
 
 
684 aa  903    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  61.16 
 
 
666 aa  791    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0442115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  75.43 
 
 
704 aa  1073    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0943361  normal  0.0152057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1925  DNA topoisomerase IV subunit B  61.02 
 
 
653 aa  774    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2827  DNA topoisomerase IV subunit B  69.77 
 
 
685 aa  934    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116959  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2484  DNA topoisomerase IV subunit B  68.37 
 
 
684 aa  907    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  66.62 
 
 
683 aa  910    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1740  DNA topoisomerase IV subunit B  60.09 
 
 
669 aa  761    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00895559  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1091  DNA topoisomerase IV subunit B  63.5 
 
 
659 aa  826    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4578  DNA topoisomerase IV subunit B  62.06 
 
 
660 aa  818    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.941273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1015  DNA topoisomerase IV subunit B  74.86 
 
 
683 aa  1065    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  69.03 
 
 
683 aa  902    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  70.65 
 
 
684 aa  960    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0749  DNA topoisomerase IV subunit B  61.19 
 
 
654 aa  776    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120428  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1328  DNA topoisomerase IV subunit B  61.47 
 
 
672 aa  833    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.070173  normal  0.202878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  70.98 
 
 
679 aa  930    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  92.35 
 
 
704 aa  1340    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  61.37 
 
 
656 aa  769    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  70.23 
 
 
678 aa  938    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0899  DNA topoisomerase IV subunit B  70.67 
 
 
692 aa  1048    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.712246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  69.42 
 
 
686 aa  945    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  71.89 
 
 
685 aa  947    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2428  DNA topoisomerase IV subunit B  62.38 
 
 
663 aa  782    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0719  DNA topoisomerase IV subunit B  50.68 
 
 
649 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  46.86 
 
 
648 aa  512  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  44.41 
 
 
636 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  44.2 
 
 
634 aa  504  1e-141  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  44.96 
 
 
644 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  44.26 
 
 
636 aa  504  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  45.23 
 
 
640 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  43.61 
 
 
640 aa  497  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  44.14 
 
 
635 aa  499  1e-139  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  43.19 
 
 
650 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  43.32 
 
 
637 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  44.38 
 
 
642 aa  489  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  44.41 
 
 
645 aa  490  1e-137  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2134  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.43 
 
 
647 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208796  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  44.99 
 
 
635 aa  487  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0105  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.05 
 
 
635 aa  488  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  44.93 
 
 
645 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  43.81 
 
 
627 aa  482  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  44.38 
 
 
642 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  44.24 
 
 
653 aa  485  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  43.16 
 
 
642 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  43.96 
 
 
641 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  42.75 
 
 
648 aa  481  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  44.24 
 
 
642 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  43.71 
 
 
644 aa  481  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  44.79 
 
 
638 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  43.93 
 
 
635 aa  476  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  42.56 
 
 
644 aa  477  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  43.56 
 
 
633 aa  478  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0374  DNA topoisomerase IV subunit B  43.17 
 
 
631 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  42.72 
 
 
632 aa  476  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  44.07 
 
 
636 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2101  DNA topoisomerase IV, B subunit  44.25 
 
 
628 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.846279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2123  DNA topoisomerase IV subunit B  44.25 
 
 
640 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.59022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  43.78 
 
 
644 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0947  DNA topoisomerase IV subunit B  42.79 
 
 
630 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.798803  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  43.93 
 
 
643 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  42.27 
 
 
643 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  43.45 
 
 
636 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  42.97 
 
 
648 aa  471  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  42.48 
 
 
655 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  41.87 
 
 
658 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  43.95 
 
 
647 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0599  DNA topoisomerase IV subunit B  42.99 
 
 
630 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  43.78 
 
 
642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.44 
 
 
633 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  44 
 
 
628 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  42.97 
 
 
649 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  44.24 
 
 
649 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  42.32 
 
 
655 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  41.96 
 
 
660 aa  472  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  42.68 
 
 
650 aa  467  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  43.46 
 
 
654 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  42.79 
 
 
637 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  43.66 
 
 
655 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  43.69 
 
 
633 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  43.28 
 
 
637 aa  463  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  41.11 
 
 
650 aa  462  1e-129  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  43.8 
 
 
640 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>