More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0719 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  52.01 
 
 		 707 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  53.55 
 
 		 701 aa  662    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0425  DNA topoisomerase IV subunit B  50.99 
 
 		 698 aa  638    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.819354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  51.83 
 
 		 685 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  52.96 
 
 		 678 aa  667    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  53.09 
 
 		 684 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  52.83 
 
 		 647 aa  661    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0029  DNA topoisomerase IV subunit B  53.04 
 
 		 653 aa  642    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2710  DNA topoisomerase IV subunit B  53.28 
 
 		 665 aa  651    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2827  DNA topoisomerase IV subunit B  52.4 
 
 		 685 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  51.74 
 
 		 682 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  53.09 
 
 		 686 aa  655    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1328  DNA topoisomerase IV subunit B  50.15 
 
 		 672 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.070173  normal  0.202878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4578  DNA topoisomerase IV subunit B  52.63 
 
 		 660 aa  638    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.941273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0719  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 649 aa  1337    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  53.55 
 
 		 685 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  51.37 
 
 		 683 aa  633  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1091  DNA topoisomerase IV subunit B  51.61 
 
 		 659 aa  634  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  52.53 
 
 		 666 aa  630  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0442115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  50.31 
 
 		 678 aa  630  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2484  DNA topoisomerase IV subunit B  51.46 
 
 		 684 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1015  DNA topoisomerase IV subunit B  51.6 
 
 		 683 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  50.83 
 
 		 704 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2428  DNA topoisomerase IV subunit B  51.4 
 
 		 663 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1215  DNA topoisomerase IV subunit B  51.87 
 
 		 691 aa  618  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0772  DNA topoisomerase IV subunit B  51.56 
 
 		 663 aa  618  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117663  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0407  DNA topoisomerase IV subunit B  51.09 
 
 		 663 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3980  DNA topoisomerase IV subunit B  51.24 
 
 		 687 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  50.83 
 
 		 683 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2978  DNA topoisomerase IV subunit B  51.31 
 
 		 684 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0591  DNA topoisomerase IV subunit B  50.77 
 
 		 699 aa  610  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0557  DNA topoisomerase IV subunit B  50.77 
 
 		 680 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0899  DNA topoisomerase IV subunit B  48.69 
 
 		 692 aa  605  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.712246  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0749  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 		 654 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120428  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  50.54 
 
 		 679 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1925  DNA topoisomerase IV subunit B  51.87 
 
 		 653 aa  603  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1740  DNA topoisomerase IV subunit B  49.84 
 
 		 669 aa  598  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00895559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  50.31 
 
 		 656 aa  598  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  50.38 
 
 		 704 aa  588  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0943361  normal  0.0152057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1062  DNA topoisomerase IV subunit B  49.69 
 
 		 686 aa  582  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2033  DNA topoisomerase IV subunit B  50.31 
 
 		 699 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2226  DNA topoisomerase IV subunit B  49.69 
 
 		 702 aa  575  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  46.25 
 
 		 640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.62 
 
 		 648 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  43.59 
 
 		 637 aa  549  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  44.3 
 
 		 636 aa  550  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  46.71 
 
 		 649 aa  549  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  44.55 
 
 		 628 aa  545  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  43.83 
 
 		 636 aa  545  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0105  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.97 
 
 		 635 aa  543  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  44.32 
 
 		 640 aa  541  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  45.07 
 
 		 644 aa  536  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  43.94 
 
 		 644 aa  531  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  46.71 
 
 		 636 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  45.89 
 
 		 645 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  45.48 
 
 		 653 aa  528  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  45.18 
 
 		 642 aa  526  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  43.48 
 
 		 633 aa  527  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  45.81 
 
 		 644 aa  527  1e-148  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  44.59 
 
 		 627 aa  527  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  44.48 
 
 		 642 aa  522  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  42.68 
 
 		 650 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  44.22 
 
 		 641 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  43.99 
 
 		 642 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  44.08 
 
 		 638 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  44.67 
 
 		 635 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  43.99 
 
 		 656 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  44.06 
 
 		 636 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4190  DNA topoisomerase IV subunit B  44.17 
 
 		 631 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  43.31 
 
 		 634 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  42.68 
 
 		 632 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2134  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.42 
 
 		 647 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  44.63 
 
 		 642 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0730  DNA topoisomerase IV subunit B  43.77 
 
 		 628 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493764 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  44.63 
 
 		 642 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0779  DNA topoisomerase IV subunit B  44.08 
 
 		 628 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.257119  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.79 
 
 		 633 aa  513  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  43.97 
 
 		 635 aa  513  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  41.78 
 
 		 644 aa  512  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  42.11 
 
 		 642 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  43.9 
 
 		 636 aa  509  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  44.43 
 
 		 640 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  43.88 
 
 		 640 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  42.92 
 
 		 652 aa  509  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2008  DNA topoisomerase IV subunit B  44.13 
 
 		 626 aa  509  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000820641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  41.19 
 
 		 644 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  42.11 
 
 		 651 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  43.9 
 
 		 641 aa  507  9.999999999999999e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  41.49 
 
 		 637 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00875  DNA topoisomerase IV subunit B  43.04 
 
 		 626 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  42.68 
 
 		 643 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3220  DNA topoisomerase IV subunit B  43.82 
 
 		 628 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3231  DNA topoisomerase IV subunit B  43.46 
 
 		 628 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.821467  hitchhiker  0.00000484218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0758  DNA topoisomerase IV subunit B  43.46 
 
 		 628 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.220488  hitchhiker  0.00186834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  42.13 
 
 		 659 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  44.43 
 
 		 640 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3899  DNA topoisomerase IV subunit B  43.89 
 
 		 628 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  42.99 
 
 		 633 aa  504  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0773  DNA topoisomerase IV subunit B  43.89 
 
 		 628 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.95291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  41.96 
 
 		 643 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>