More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1091 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0407  DNA topoisomerase IV subunit B  60.18 
 
 		 663 aa  758    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  62.13 
 
 		 679 aa  786    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  63.08 
 
 		 704 aa  787    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0943361  normal  0.0152057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3980  DNA topoisomerase IV subunit B  60.9 
 
 		 687 aa  767    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1215  DNA topoisomerase IV subunit B  60.74 
 
 		 691 aa  764    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4578  DNA topoisomerase IV subunit B  80.15 
 
 		 660 aa  1107    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.941273 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0591  DNA topoisomerase IV subunit B  63.83 
 
 		 699 aa  827    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1062  DNA topoisomerase IV subunit B  63.64 
 
 		 686 aa  781    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2428  DNA topoisomerase IV subunit B  59.42 
 
 		 663 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  61.38 
 
 		 685 aa  794    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0425  DNA topoisomerase IV subunit B  61.85 
 
 		 698 aa  799    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.819354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  61.14 
 
 		 685 aa  796    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  62.81 
 
 		 678 aa  801    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0772  DNA topoisomerase IV subunit B  59.27 
 
 		 663 aa  750    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  62.58 
 
 		 682 aa  811    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  62.85 
 
 		 707 aa  793    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0749  DNA topoisomerase IV subunit B  56.9 
 
 		 654 aa  715    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120428  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2710  DNA topoisomerase IV subunit B  63.14 
 
 		 665 aa  809    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  59.68 
 
 		 678 aa  784    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2978  DNA topoisomerase IV subunit B  61.44 
 
 		 684 aa  771    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  78.23 
 
 		 666 aa  1081    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0442115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  61.38 
 
 		 701 aa  792    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1925  DNA topoisomerase IV subunit B  59.18 
 
 		 653 aa  750    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2827  DNA topoisomerase IV subunit B  61.82 
 
 		 685 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  60.37 
 
 		 683 aa  755    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2484  DNA topoisomerase IV subunit B  61.75 
 
 		 684 aa  777    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0029  DNA topoisomerase IV subunit B  62.69 
 
 		 653 aa  790    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  59.26 
 
 		 683 aa  788    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1740  DNA topoisomerase IV subunit B  58.42 
 
 		 669 aa  738    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00895559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1091  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 659 aa  1354    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  63.78 
 
 		 684 aa  814    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1015  DNA topoisomerase IV subunit B  62.4 
 
 		 683 aa  808    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2226  DNA topoisomerase IV subunit B  64.11 
 
 		 702 aa  803    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1328  DNA topoisomerase IV subunit B  58.58 
 
 		 672 aa  775    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.070173  normal  0.202878 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0557  DNA topoisomerase IV subunit B  63.83 
 
 		 680 aa  825    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2033  DNA topoisomerase IV subunit B  63.08 
 
 		 699 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  59.73 
 
 		 656 aa  752    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  62.73 
 
 		 704 aa  818    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  61.85 
 
 		 647 aa  799    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  62.39 
 
 		 686 aa  794    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0899  DNA topoisomerase IV subunit B  60.41 
 
 		 692 aa  791    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.712246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0719  DNA topoisomerase IV subunit B  51.61 
 
 		 649 aa  634  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2134  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  46.14 
 
 		 647 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  46.04 
 
 		 648 aa  535  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  43.71 
 
 		 636 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  44.08 
 
 		 650 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  43.4 
 
 		 636 aa  501  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0105  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.06 
 
 		 635 aa  498  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  45.33 
 
 		 640 aa  497  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  44.62 
 
 		 644 aa  498  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0599  DNA topoisomerase IV subunit B  44.67 
 
 		 630 aa  494  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  42.39 
 
 		 648 aa  491  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  42.64 
 
 		 637 aa  489  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  41.9 
 
 		 635 aa  487  1e-136  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0947  DNA topoisomerase IV subunit B  44.72 
 
 		 630 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.798803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3558  DNA topoisomerase IV subunit B  45.59 
 
 		 631 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236932  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0730  DNA topoisomerase IV subunit B  44.09 
 
 		 628 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4190  DNA topoisomerase IV subunit B  45.05 
 
 		 631 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02902  DNA topoisomerase IV subunit B  44.29 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0670  DNA topoisomerase IV, B subunit  44.29 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4263  DNA topoisomerase IV subunit B  45.05 
 
 		 631 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00013039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3494  DNA topoisomerase IV subunit B  44.29 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4176  DNA topoisomerase IV subunit B  43.82 
 
 		 628 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.599957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  44.6 
 
 		 630 aa  482  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3463  DNA topoisomerase IV subunit B  44.29 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  43.67 
 
 		 641 aa  482  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  44.6 
 
 		 630 aa  482  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0667  DNA topoisomerase IV subunit B  44.29 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.428879  decreased coverage  0.00919443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3367  DNA topoisomerase IV subunit B  44.6 
 
 		 630 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02852  hypothetical protein  44.29 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  44.6 
 
 		 630 aa  482  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  42.59 
 
 		 640 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4344  DNA topoisomerase IV subunit B  44.29 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  41.81 
 
 		 634 aa  480  1e-134  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0374  DNA topoisomerase IV subunit B  44.69 
 
 		 631 aa  482  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  44.6 
 
 		 630 aa  482  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3208  DNA topoisomerase IV subunit B  44.29 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3325  DNA topoisomerase IV subunit B  44.29 
 
 		 630 aa  480  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0659  DNA topoisomerase IV subunit B  45.21 
 
 		 631 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0578  DNA topoisomerase IV subunit B  45.21 
 
 		 631 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3614  DNA topoisomerase IV subunit B  44.77 
 
 		 631 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0279  DNA topoisomerase IV subunit B  45.21 
 
 		 631 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2101  DNA topoisomerase IV, B subunit  45.48 
 
 		 628 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.846279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0319  DNA topoisomerase IV subunit B  44.53 
 
 		 631 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3772  DNA topoisomerase IV subunit B  44.62 
 
 		 631 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0746  DNA topoisomerase IV subunit B  43.98 
 
 		 626 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0727  DNA topoisomerase IV subunit B  43.98 
 
 		 626 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0779  DNA topoisomerase IV subunit B  45.01 
 
 		 628 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.257119  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0328  DNA topoisomerase IV subunit B  44.84 
 
 		 631 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934863  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.68 
 
 		 633 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3443  DNA topoisomerase IV subunit B  44.29 
 
 		 630 aa  478  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.411939  normal  0.211337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  43.97 
 
 		 628 aa  476  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  44.55 
 
 		 666 aa  476  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  41.93 
 
 		 645 aa  472  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0499  DNA topoisomerase IV subunit B  45.15 
 
 		 635 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  42.26 
 
 		 655 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3220  DNA topoisomerase IV subunit B  44.68 
 
 		 628 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1446  DNA topoisomerase IV subunit B  44.67 
 
 		 629 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0951751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  43.67 
 
 		 644 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3043  DNA topoisomerase IV subunit B  44.84 
 
 		 628 aa  475  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>