More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3534 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02902  DNA topoisomerase IV subunit B  96.67 
 
 
630 aa  1269    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0670  DNA topoisomerase IV, B subunit  96.67 
 
 
630 aa  1269    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0132  DNA topoisomerase IV subunit B  66.56 
 
 
636 aa  900    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000115849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4915  DNA topoisomerase IV subunit B  72.58 
 
 
634 aa  964    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3494  DNA topoisomerase IV subunit B  96.67 
 
 
630 aa  1269    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0820  DNA topoisomerase IV subunit B  68.89 
 
 
628 aa  921    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.676318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43480  DNA topoisomerase IV subunit B  75.32 
 
 
630 aa  997    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4791  DNA topoisomerase IV subunit B  72.58 
 
 
634 aa  964    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543353  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1137  DNA topoisomerase IV subunit B  50.38 
 
 
660 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4176  DNA topoisomerase IV subunit B  74.2 
 
 
628 aa  1004    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.599957  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0773  DNA topoisomerase IV subunit B  73.97 
 
 
628 aa  979    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.95291  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2255  DNA topoisomerase IV subunit B  65.82 
 
 
629 aa  850    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3208  DNA topoisomerase IV subunit B  96.67 
 
 
630 aa  1269    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3899  DNA topoisomerase IV subunit B  74.76 
 
 
628 aa  989    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4963  DNA topoisomerase IV, B subunit  72.81 
 
 
634 aa  966    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3573  DNA topoisomerase IV subunit B  74.44 
 
 
628 aa  981    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1145  DNA topoisomerase IV subunit B  50.38 
 
 
660 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0778193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5696  DNA topoisomerase IV subunit B  75.04 
 
 
629 aa  989    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.976581  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1983  DNA topoisomerase IV subunit B  66.03 
 
 
636 aa  862    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  50.38 
 
 
660 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1205  DNA topoisomerase IV subunit B  49.92 
 
 
661 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2208  DNA topoisomerase IV subunit B  50.38 
 
 
660 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0746  DNA topoisomerase IV subunit B  64.82 
 
 
626 aa  877    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0727  DNA topoisomerase IV subunit B  64.82 
 
 
626 aa  876    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0551  DNA topoisomerase IV subunit B  73.21 
 
 
634 aa  966    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2094  DNA topoisomerase IV subunit B  64.08 
 
 
628 aa  828    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.104639  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1867  DNA topoisomerase IV subunit B  49.85 
 
 
662 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0719699  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4263  DNA topoisomerase IV subunit B  91.73 
 
 
631 aa  1205    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00013039 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0919  DNA topoisomerase IV subunit B  50.46 
 
 
660 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0180456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 
630 aa  1305    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4707  DNA topoisomerase IV subunit B  73.29 
 
 
634 aa  967    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.590641  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1300  DNA topoisomerase IV subunit B  50.38 
 
 
660 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2283  DNA topoisomerase IV subunit B  68.1 
 
 
628 aa  895    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0415043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0499  DNA topoisomerase IV subunit B  73.68 
 
 
635 aa  972    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2278  DNA topoisomerase IV subunit B  50.23 
 
 
660 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5699  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
660 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3554  DNA topoisomerase IV subunit B  67.99 
 
 
632 aa  921    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0604  DNA topoisomerase IV subunit B  74.32 
 
 
632 aa  976    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0319  DNA topoisomerase IV subunit B  90.75 
 
 
631 aa  1194    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0364  DNA topoisomerase IV subunit B  67.62 
 
 
628 aa  895    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0549  DNA topoisomerase IV subunit B  74.29 
 
 
628 aa  986    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2008  DNA topoisomerase IV subunit B  80.41 
 
 
626 aa  1073    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000820641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3558  DNA topoisomerase IV subunit B  74.6 
 
 
631 aa  1013    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0578  DNA topoisomerase IV subunit B  91.13 
 
 
631 aa  1209    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0564  DNA topoisomerase IV subunit B  64.24 
 
 
629 aa  862    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2670  DNA topoisomerase IV subunit B  80.25 
 
 
626 aa  1069    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0940  DNA topoisomerase IV subunit B  50.23 
 
 
660 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0156854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0279  DNA topoisomerase IV subunit B  91.13 
 
 
631 aa  1209    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0659  DNA topoisomerase IV subunit B  91.13 
 
 
631 aa  1209    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59712  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2526  DNA topoisomerase IV subunit B  50.38 
 
 
660 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2381  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
660 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0328  DNA topoisomerase IV subunit B  90.75 
 
 
631 aa  1193    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934863  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0374  DNA topoisomerase IV subunit B  71.09 
 
 
631 aa  954    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3325  DNA topoisomerase IV subunit B  96.35 
 
 
630 aa  1271    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.707036 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3614  DNA topoisomerase IV subunit B  90.97 
 
 
631 aa  1197    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3339  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
661 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3220  DNA topoisomerase IV subunit B  73.97 
 
 
628 aa  983    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128884  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0818  DNA topoisomerase IV subunit B  74.44 
 
 
628 aa  981    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0667  DNA topoisomerase IV subunit B  96.67 
 
 
630 aa  1269    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.428879  decreased coverage  0.00919443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2544  DNA topoisomerase IV subunit B  70.16 
 
 
626 aa  928    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0612  DNA topoisomerase IV subunit B  64.24 
 
 
629 aa  863    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2414  DNA topoisomerase IV subunit B  65.03 
 
 
628 aa  842    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.752872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 
630 aa  1305    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00177  DNA topoisomerase IV subunit B  64.4 
 
 
629 aa  869    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.771486  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2123  DNA topoisomerase IV subunit B  71.99 
 
 
640 aa  977    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.59022  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1748  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
660 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4190  DNA topoisomerase IV subunit B  72.7 
 
 
631 aa  981    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0435  DNA topoisomerase IV subunit B  74.8 
 
 
629 aa  1011    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0811  DNA topoisomerase IV subunit B  74.44 
 
 
628 aa  981    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000501954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2043  DNA topoisomerase IV subunit B  66.4 
 
 
641 aa  897    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03685  DNA topoisomerase IV subunit B  76.39 
 
 
631 aa  1028    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1446  DNA topoisomerase IV subunit B  65.61 
 
 
629 aa  880    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0951751  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0599  DNA topoisomerase IV subunit B  75.12 
 
 
630 aa  1002    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3231  DNA topoisomerase IV subunit B  74.6 
 
 
628 aa  988    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.821467  hitchhiker  0.00000484218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0758  DNA topoisomerase IV subunit B  74.6 
 
 
628 aa  988    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.220488  hitchhiker  0.00186834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0947  DNA topoisomerase IV subunit B  67.25 
 
 
630 aa  909    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.798803  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3327  DNA topoisomerase IV subunit B  73.49 
 
 
628 aa  979    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.603705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 
630 aa  1305    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00875  DNA topoisomerase IV subunit B  79.46 
 
 
626 aa  1063    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2396  DNA topoisomerase IV subunit B  49.92 
 
 
660 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65660  DNA topoisomerase IV subunit B  75.36 
 
 
629 aa  993    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0786  DNA topoisomerase IV subunit B  74.29 
 
 
628 aa  977    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4968  DNA topoisomerase IV subunit B  72.58 
 
 
634 aa  962    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.713463  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02852  hypothetical protein  96.67 
 
 
630 aa  1269    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3772  DNA topoisomerase IV subunit B  90.49 
 
 
631 aa  1192    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1753  DNA topoisomerase IV, B subunit  67.88 
 
 
638 aa  896    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2360  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 
660 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3367  DNA topoisomerase IV subunit B  99.84 
 
 
630 aa  1302    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 
630 aa  1305    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0730  DNA topoisomerase IV subunit B  74.29 
 
 
628 aa  1004    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3463  DNA topoisomerase IV subunit B  96.51 
 
 
630 aa  1269    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3443  DNA topoisomerase IV subunit B  95.55 
 
 
630 aa  1266    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.411939  normal  0.211337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3043  DNA topoisomerase IV subunit B  74.52 
 
 
628 aa  992    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3354  DNA topoisomerase IV subunit B  73.38 
 
 
629 aa  984    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.778526  normal  0.0858286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2794  DNA topoisomerase IV subunit B  71.59 
 
 
631 aa  954    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197709  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4344  DNA topoisomerase IV subunit B  96.51 
 
 
630 aa  1267    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004517  topoisomerase IV subunit B  77.48 
 
 
553 aa  920    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3428  DNA topoisomerase IV subunit B  50.93 
 
 
665 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0779  DNA topoisomerase IV subunit B  72.22 
 
 
628 aa  980    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.257119  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0694  DNA topoisomerase IV subunit B  50.38 
 
 
660 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>