More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0772 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2428  DNA topoisomerase IV subunit B  99.7 
 
 		 663 aa  1362    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  63.31 
 
 		 685 aa  816    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  58.7 
 
 		 678 aa  759    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  61.27 
 
 		 678 aa  788    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  60.65 
 
 		 707 aa  764    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0591  DNA topoisomerase IV subunit B  62.38 
 
 		 699 aa  810    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  62.58 
 
 		 682 aa  805    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1062  DNA topoisomerase IV subunit B  61.96 
 
 		 686 aa  773    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  61.4 
 
 		 679 aa  786    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0425  DNA topoisomerase IV subunit B  61.09 
 
 		 698 aa  789    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.819354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4578  DNA topoisomerase IV subunit B  60.9 
 
 		 660 aa  802    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.941273 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0557  DNA topoisomerase IV subunit B  62.38 
 
 		 680 aa  810    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  60.7 
 
 		 685 aa  794    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2226  DNA topoisomerase IV subunit B  60.31 
 
 		 702 aa  753    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0772  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 663 aa  1365    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0749  DNA topoisomerase IV subunit B  81.37 
 
 		 654 aa  1076    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120428  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0407  DNA topoisomerase IV subunit B  97.74 
 
 		 663 aa  1314    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2710  DNA topoisomerase IV subunit B  60.43 
 
 		 665 aa  793    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2978  DNA topoisomerase IV subunit B  60.71 
 
 		 684 aa  770    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  59.94 
 
 		 666 aa  775    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0442115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1925  DNA topoisomerase IV subunit B  81.93 
 
 		 653 aa  1092    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2827  DNA topoisomerase IV subunit B  60.34 
 
 		 685 aa  784    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2484  DNA topoisomerase IV subunit B  60.27 
 
 		 684 aa  765    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2033  DNA topoisomerase IV subunit B  59.91 
 
 		 699 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  61.77 
 
 		 683 aa  808    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  62.29 
 
 		 686 aa  815    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1740  DNA topoisomerase IV subunit B  81.75 
 
 		 669 aa  1083    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00895559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1091  DNA topoisomerase IV subunit B  59.27 
 
 		 659 aa  770    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  63.09 
 
 		 684 aa  810    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1015  DNA topoisomerase IV subunit B  60.99 
 
 		 683 aa  800    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  63.78 
 
 		 647 aa  822    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1215  DNA topoisomerase IV subunit B  60.03 
 
 		 691 aa  773    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  59.91 
 
 		 683 aa  761    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  61.54 
 
 		 704 aa  808    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1328  DNA topoisomerase IV subunit B  58.53 
 
 		 672 aa  764    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.070173  normal  0.202878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  59.54 
 
 		 704 aa  754    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0943361  normal  0.0152057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0029  DNA topoisomerase IV subunit B  57.92 
 
 		 653 aa  725    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0719  DNA topoisomerase IV subunit B  52.02 
 
 		 649 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1836  DNA topoisomerase IV subunit B  83.99 
 
 		 656 aa  1110    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3980  DNA topoisomerase IV subunit B  60.28 
 
 		 687 aa  751    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0899  DNA topoisomerase IV subunit B  57.98 
 
 		 692 aa  763    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.712246  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  63.31 
 
 		 701 aa  816    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  45.37 
 
 		 636 aa  532  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.56 
 
 		 648 aa  535  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  45.22 
 
 		 636 aa  529  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2134  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.76 
 
 		 647 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  45.68 
 
 		 644 aa  522  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  44.36 
 
 		 650 aa  519  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  45.43 
 
 		 640 aa  520  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0105  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  46.89 
 
 		 635 aa  517  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  44.18 
 
 		 647 aa  514  1e-144  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  45.13 
 
 		 640 aa  511  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  44.56 
 
 		 644 aa  508  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  44.15 
 
 		 644 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  45.85 
 
 		 645 aa  496  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  43.57 
 
 		 648 aa  495  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02902  DNA topoisomerase IV subunit B  42.83 
 
 		 630 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0670  DNA topoisomerase IV, B subunit  42.83 
 
 		 630 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3463  DNA topoisomerase IV subunit B  42.83 
 
 		 630 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  43.43 
 
 		 654 aa  492  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  44.41 
 
 		 642 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3494  DNA topoisomerase IV subunit B  42.83 
 
 		 630 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00875  DNA topoisomerase IV subunit B  42.99 
 
 		 626 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3208  DNA topoisomerase IV subunit B  42.83 
 
 		 630 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4344  DNA topoisomerase IV subunit B  42.83 
 
 		 630 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  42.57 
 
 		 630 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  42.57 
 
 		 630 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0328  DNA topoisomerase IV subunit B  42.9 
 
 		 631 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934863  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  43.97 
 
 		 641 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02852  hypothetical protein  42.83 
 
 		 630 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  44.36 
 
 		 644 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0319  DNA topoisomerase IV subunit B  43.15 
 
 		 631 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  42.57 
 
 		 630 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  42.57 
 
 		 630 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  44.83 
 
 		 645 aa  494  9.999999999999999e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  44.53 
 
 		 642 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0667  DNA topoisomerase IV subunit B  42.83 
 
 		 630 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.428879  decreased coverage  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3325  DNA topoisomerase IV subunit B  42.68 
 
 		 630 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  42.75 
 
 		 636 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  44.07 
 
 		 635 aa  491  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  43.23 
 
 		 627 aa  489  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  45.15 
 
 		 633 aa  491  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  43.43 
 
 		 649 aa  492  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0374  DNA topoisomerase IV subunit B  43.93 
 
 		 631 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  44.09 
 
 		 632 aa  490  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  43.65 
 
 		 645 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.92 
 
 		 633 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  45.45 
 
 		 649 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  44.1 
 
 		 633 aa  489  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  44.48 
 
 		 643 aa  491  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  44.79 
 
 		 643 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3367  DNA topoisomerase IV subunit B  42.57 
 
 		 630 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  44.46 
 
 		 649 aa  488  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  42.66 
 
 		 637 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3614  DNA topoisomerase IV subunit B  42.33 
 
 		 631 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2101  DNA topoisomerase IV, B subunit  43.52 
 
 		 628 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.846279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  43.5 
 
 		 653 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  44.07 
 
 		 633 aa  487  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  43.85 
 
 		 666 aa  486  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  44.05 
 
 		 638 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>