More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3641 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3641  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  556  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1728  regulatory protein, LysR  95.24 
 
 		 294 aa  531  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0729139  normal  0.555959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01180  transcriptional regulator  70.57 
 
 		 284 aa  363  2e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1794  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1913  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3600  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.4 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326456  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3682  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2539  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4108  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4258  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000322275  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1753  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0990804  normal  0.117746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3227  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0157  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4155  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532001  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4332  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.192569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30450  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3259  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0956  transcriptional regulator, LysR family  33.14 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5695  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.68 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5230  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957267  normal  0.114688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2663  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3312  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00186947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2381  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128975  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7793  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4027  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3495  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2958  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0252  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.682198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1604  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3703  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0011  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  31.28 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4461  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2217  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.335771  normal  0.670692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  39.81 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0133  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3119  transcriptional regulatory protein  33.87 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234841  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4012  putative LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0229  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00000000369009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0213  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718825  unclonable  0.0000000000104245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0237  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618389  unclonable  0.0000000000250683 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0290  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000353581  unclonable  0.0000000000404999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2796  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000015017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0027  transcriptional regulatory protein  33.53 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000739069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3798  LysR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3859  LysR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000387155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  29.18 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  29.54 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1630  LysR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  33.16 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1550  transcriptional regulator, LysR family  30.46 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.93213 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5068  LysR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.728384 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  30.73 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3409  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000205674  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5829  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.438872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0738  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4981  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  28.97 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  48.1 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1984  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4404  transcriptional regulator, LysR family  29.94 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2533  LysR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2406  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  44.3 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1784  transcriptional regulator, LysR family  28.17 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2363  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704968  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0946  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>