More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0486 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  35.25 
 
 		 307 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  36.03 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  32.34 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1229  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  31.35 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1176  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1238  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0757  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0649321  hitchhiker  0.00000000000185675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4872  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.511733  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  26.47 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06000  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.271316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  29.81 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0157  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2118  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0495848  normal  0.686306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  25.67 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0410  hypothetical protein  26.29 
 
 		 219 aa  86.7  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.340572  hitchhiker  0.00753399 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  31.4 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  29.36 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  31.88 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6822  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 297 aa  85.9  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  31.75 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08730  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.188975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2215  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0795  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  25.72 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  0.00000124662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2218  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.573789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0335  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  37.91 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  29.06 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08390  LysR family regulator  24.15 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0347693  normal  0.270686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1039  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.204243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  26.7 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  32.84 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  31.75 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0761  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.211674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0907  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40910  LysR family transcriptional regulatory protein  30.81 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0664  transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1847  transcriptional regulator, LysR family  26.47 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0360  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  32.24 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3369  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384644 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  28.44 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1383  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0933  transcriptional regulator, LysR family  24.84 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  31.78 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1158  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4390  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4535  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  27.5 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>