More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1753 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1753  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
305 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0990804  normal  0.117746 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4258  LysR family transcriptional regulator  94.43 
 
 
324 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000322275  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3259  LysR family transcriptional regulator  94.41 
 
 
307 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4108  LysR family transcriptional regulator  94.43 
 
 
324 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4332  LysR family transcriptional regulator  89.83 
 
 
322 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.192569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4155  LysR family transcriptional regulator  91.64 
 
 
307 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532001  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3682  LysR family transcriptional regulator  92.36 
 
 
326 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1794  transcriptional regulator, LysR family  50.69 
 
 
301 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2539  LysR family transcriptional regulator  51.24 
 
 
296 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00516112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3227  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
296 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3600  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  50.35 
 
 
322 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326456  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30450  LysR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
298 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30980  Transcriptional regulator LysR family protein  51.1 
 
 
303 aa  265  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1550  transcriptional regulator, LysR family  47.62 
 
 
303 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.93213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21680  Transcriptional regulator, LysR family  49.42 
 
 
273 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5230  LysR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
212 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957267  normal  0.114688 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1243  LysR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
316 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1913  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
281 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3798  LysR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
312 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3859  LysR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
312 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000387155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0027  transcriptional regulatory protein  41.01 
 
 
312 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000739069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3119  transcriptional regulatory protein  41.01 
 
 
312 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0213  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718825  unclonable  0.0000000000104245 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0290  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000353581  unclonable  0.0000000000404999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2796  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000015017  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0229  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
306 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00000000369009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0237  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
306 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618389  unclonable  0.0000000000250683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3409  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000205674  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0310  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
292 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 
292 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  24.73 
 
 
303 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  25.1 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.22 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  26.15 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5880  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311857  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  26.9 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5516  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0587498  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6389  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0907959  normal  0.0995777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  24.71 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0650  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.344002 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  24.69 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0002  transcriptional regulator, LysR family  28.3 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  23.38 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4118  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00686854  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.98 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4767  LysR family transcriptional regulator  23.67 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  23.87 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.33 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.33 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.33 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.33 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  26.33 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.33 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  28.34 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.33 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.33 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  26.33 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  24.28 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.57 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  24.28 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1993  putative transcriptional regulator  31.79 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1502  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  24.56 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.57 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2780  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.98 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.98 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.98 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.98 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.98 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  23.35 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1398  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.37 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.98 
 
 
302 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1636  putative LysR substrate binding domain  24.64 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1812  putative LysR substrate binding domain-containing protein  24.64 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  29.95 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  26.2 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1196  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1695  putative LysR substrate binding domain  24.64 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.98 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1647  putative LysR substrate binding domain  24.64 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0636291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1628  putative LysR substrate binding domain  24.64 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.2 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>