More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1913 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1913  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 281 aa  557  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3227  LysR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2539  LysR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3600  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  45.98 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326456  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1794  transcriptional regulator, LysR family  45.59 
 
 		 301 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30980  Transcriptional regulator LysR family protein  45.98 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30450  LysR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1550  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.93213 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5230  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 212 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957267  normal  0.114688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21680  Transcriptional regulator, LysR family  42.49 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4332  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.192569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1753  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0990804  normal  0.117746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3119  transcriptional regulatory protein  43.13 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234841  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4155  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532001  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4258  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000322275  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4108  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0027  transcriptional regulatory protein  41.98 
 
 		 312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000739069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3798  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3859  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000387155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3259  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0290  LysR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000353581  unclonable  0.0000000000404999 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1243  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2796  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000015017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0213  LysR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718825  unclonable  0.0000000000104245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0229  LysR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00000000369009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0237  LysR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618389  unclonable  0.0000000000250683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3409  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 309 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000205674  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3682  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0310  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1345  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 290 aa  92  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 297 aa  92  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6666  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  26.45 
 
 		 296 aa  89  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 315 aa  89  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1536  LysR, substrate-binding  30.83 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  30.43 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2178  transcriptional regulator, LysR family  37.58 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0017  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.163482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3484  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.719553  normal  0.357365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2188  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  27.82 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2070  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518674  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3641  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2079  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843078  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  26.91 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0210  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4028  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  27.6 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1484  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  26.19 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000079886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1241  transcriptional regulator, LysR family  29.12 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 320 aa  82  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.94 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2540  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6254  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.79 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2440  transcriptional regulator, putative hydrogen peroxide-inducible regulon activator  28.51 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  25.54 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0665  putative transcriptional regulator OxyR  27.02 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1908  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.605315  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6676  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6344  transcriptional regulator, LysR family  28.79 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1600  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48440  Transcriptional regulator, LysR family protein  27.48 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0556278  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4764  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4254  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  23.16 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  38.66 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  38.66 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1769  LysR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0244764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  25.46 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2940  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0170064  decreased coverage  0.0000113665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4759  transcriptional regulator, LysR family  25.98 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.658857  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0947  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0281  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>