More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01180 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01180  transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  534  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1728  regulatory protein, LysR  70.57 
 
 		 294 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0729139  normal  0.555959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3641  LysR family transcriptional regulator  70.57 
 
 		 294 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0157  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1913  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1794  transcriptional regulator, LysR family  30.06 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3600  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.06 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326456  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  30.93 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  31.78 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1753  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0990804  normal  0.117746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4404  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2539  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4258  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000322275  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4115  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4108  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3227  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3259  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0956  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0252  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.682198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5230  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957267  normal  0.114688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2533  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4332  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.192569 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4155  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532001  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2877  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4718  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.27 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5695  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.14 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0029  regulatory protein, LysR  31.94 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3682  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2661  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3312  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00186947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2406  transcriptional regulator, LysR family  48.53 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2978  LysR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.74 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2711  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2217  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.335771  normal  0.670692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6265  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.05074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0434  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3995  transcriptional regulator, LysR family  27.14 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3703  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6667  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2792  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6432  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6490  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0639  LysR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  30.37 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3318  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6126  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5999  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3128  LysR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2902  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.374405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5634  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1979  transcriptional regulator CysB  32.17 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0133  transcriptional regulator, LysR family  26.18 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2395  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.11 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0377245  normal  0.580313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  28.17 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4032  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124672  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 317 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  30.81 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4952  LysR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.885595  normal  0.690392 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6153  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6165  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516449  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1604  transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0186  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.142233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  40.66 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3787  transcriptional regulator, LysR family  54.24 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5351  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7408  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  44.74 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2932  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4801  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0036  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2711  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.991378  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4810  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1550  transcriptional regulator, LysR family  30.12 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.93213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6818  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1043  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.805531  normal  0.622996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>