More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0375 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  616  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 301 aa  345  8e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 301 aa  333  1e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  33 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  34.51 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  33 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  32.24 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1229  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  27.85 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1176  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1238  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  30.1 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0933  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  30.1 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0360  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0810  transcriptional regulator, LysR family  25.81 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1907  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 289 aa  92.4  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3987  LysR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0157  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0711  transcriptional regulator, LysR family  30.81 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3244  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2958  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.28 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.28 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2625  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3813  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0757  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0649321  hitchhiker  0.00000000000185675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3718  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  27.85 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0693  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0589363  normal  0.107501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2522  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196222  normal  0.718346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0640  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0241  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0594299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0725  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0204  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0533244  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3367  oxidative stress regulatory protein  29.8 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3358  oxidative stress regulatory protein OxyR  29.8 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3324  oxidative stress regulatory protein OxyR  29.8 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519513  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2661  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.230449 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0615  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  29.8 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0307  oxidative stress regulatory protein OxyR  29.8 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2390  oxidative stress regulatory protein OxyR  29.8 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1798  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103195  normal  0.329714 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2576  oxidative stress regulatory protein OxyR  29.8 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  27.46 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1281  oxidative stress regulatory protein OxyR  29.8 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1195  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.279757  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2217  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.335771  normal  0.670692 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.73 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0368  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0377  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1826  transcriptional regulator, LysR family  26.99 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0678  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26180  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  29.5 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2782  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  27.32 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0066  oxidative stress regulatory protein OxyR, putative  30.5 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3761  redox-sensitive transcriptional activator OxyR  28.36 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0252  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.682198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.92 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0594  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1664  LysR substrate-binding protein  34.01 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4197  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>