131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0222 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  46.57 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  47 
 
 		 206 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  47.72 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  47.67 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  49.5 
 
 		 218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  45.73 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  45 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  45.23 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  44.22 
 
 		 200 aa  177  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  36.89 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  34.33 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  35.03 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  34.33 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  34.47 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  36.06 
 
 		 197 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  33.17 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  33.5 
 
 		 195 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  28.71 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  33.16 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  30.93 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  33.84 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  27.64 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  26.07 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.91 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  30.26 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  26.5 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  29.7 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  27.08 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  25.62 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  30.1 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  24.63 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  27.91 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  30.24 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  23.15 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  23.04 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4964  hypothetical protein  40.45 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>