130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3753 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
217 aa  434  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  99.54 
 
 
217 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  77.67 
 
 
216 aa  333  7.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  72.3 
 
 
211 aa  312  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  75.12 
 
 
218 aa  304  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  61.29 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  62.04 
 
 
229 aa  241  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  60 
 
 
210 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  56.74 
 
 
217 aa  216  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  50.67 
 
 
218 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  39.81 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  39.35 
 
 
212 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  38.36 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  38.14 
 
 
212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 
210 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  33 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0733  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 
212 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0716  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 
212 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759492  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  32.86 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.07 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0747  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 
208 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.340191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2418  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 
214 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  33.81 
 
 
723 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.81 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.81 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0883  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.81 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.81 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  33.81 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1893  thioredoxin domain-containing protein  33.81 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2547  DSBA oxidoreductase  34.45 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.435599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 
200 aa  91.7  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 
197 aa  89  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3929  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559828  normal  0.0117415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0353  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.824557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0837  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0809  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  31.98 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  31.77 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  32.81 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  31.47 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  35.23 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  30.15 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03849  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07870)  28.71 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728654  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  29.17 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  29.35 
 
 
201 aa  72  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  30.35 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  29.06 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  31.63 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 
195 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  30.69 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  27 
 
 
210 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  27 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 
197 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  29 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
207 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  25.13 
 
 
200 aa  55.1  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>