149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3908 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 196 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  62.24 
 
 		 197 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  60 
 
 		 196 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  59.49 
 
 		 196 aa  255  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  60.71 
 
 		 200 aa  253  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  62.24 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  60.71 
 
 		 197 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  61.22 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  58.97 
 
 		 197 aa  244  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  61.54 
 
 		 195 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  60.2 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  60.51 
 
 		 195 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  51.79 
 
 		 197 aa  220  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  44.67 
 
 		 195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  42.5 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  41.5 
 
 		 200 aa  160  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  44.95 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  40.61 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  42.49 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  40.51 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  41.45 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  39.5 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  40.41 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  39.38 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  38.54 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  32.49 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  36.61 
 
 		 202 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  34.01 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  32.49 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 		 218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  32.83 
 
 		 201 aa  117  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  37.17 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  32.49 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  33.83 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  35.57 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  32.61 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  30.05 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  33.69 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  30.21 
 
 		 199 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  33.69 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  31.25 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 		 223 aa  99.4  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03849  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07870)  29.65 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 208 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  29.5 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 232 aa  94.4  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  30.05 
 
 		 218 aa  92.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  27.27 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  26.26 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  33.33 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  31.12 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 		 212 aa  84.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  26 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4651  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  0.692086 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>