147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1459 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  71.21 
 
 		 199 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  70.2 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  43.15 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  38.34 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  37.81 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  38.74 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  38.1 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  37.11 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  37.57 
 
 		 201 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  32.46 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  32.61 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  30.26 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 		 197 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  27.08 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  33 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  33.98 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  31.25 
 
 		 195 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 196 aa  91.7  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  29.32 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  31.55 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 201 aa  88.2  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  27.37 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  26.18 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  28.72 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  28.79 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  27 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  23.56 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  28.44 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  26.26 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  25.51 
 
 		 201 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  29.03 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  24.49 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  26.84 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  27.04 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  24.23 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  26.26 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4651  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.04 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  23.9 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.04 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.04 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  28.04 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>