127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3344 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
218 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  96.33 
 
 
218 aa  420  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  60.66 
 
 
216 aa  256  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 
201 aa  170  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 
201 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  45.27 
 
 
207 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  42.13 
 
 
198 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  45.27 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  43.78 
 
 
207 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  48.09 
 
 
204 aa  161  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 
208 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  41.45 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 
209 aa  147  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  42.93 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  40.39 
 
 
214 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  43.08 
 
 
199 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  42.05 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
219 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  41.24 
 
 
201 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 
199 aa  121  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  38.27 
 
 
199 aa  121  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  39.49 
 
 
201 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  36.87 
 
 
198 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  39.5 
 
 
199 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 
198 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 
197 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
197 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  31.44 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 
201 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 
201 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
196 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
201 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 
200 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  29.44 
 
 
195 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
197 aa  87  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  30.2 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 
219 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  29.23 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 
200 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  28.43 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  28.21 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 
201 aa  79  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  24.75 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  26.09 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  32.11 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  25.37 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  26.21 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  24.1 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 
208 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
224 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  32.29 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  21.83 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  32.82 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25.65 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0361  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.843248 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>