152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2292 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  93.75 
 
 		 208 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  77.78 
 
 		 208 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  72.95 
 
 		 208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  76.92 
 
 		 208 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  55.67 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  51.27 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  54.4 
 
 		 195 aa  201  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  50.26 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  47.15 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  48.44 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  43.81 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  48.39 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  45.36 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  46.43 
 
 		 232 aa  167  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  37.17 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  36.13 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  35.6 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  37.37 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  33.97 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  36.9 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  35.53 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  36.36 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  34.85 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  36.6 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  35.57 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  32.11 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  31.25 
 
 		 200 aa  98.2  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  30.93 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  35.15 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  34.21 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  32.2 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  32.63 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  31.09 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  26.2 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  29.32 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  31.09 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  25.79 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  27.4 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  26.98 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  24.6 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  25.13 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  29.59 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  25.64 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  24.21 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5212  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase-like protein  27.37 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>