136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4707 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 214 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  62.67 
 
 		 217 aa  261  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  62.21 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  64.49 
 
 		 229 aa  256  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  60.19 
 
 		 216 aa  250  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  63.86 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  60.73 
 
 		 210 aa  241  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  61.01 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  60.71 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  52.4 
 
 		 218 aa  204  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  39.59 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  39.59 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  39.09 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  37.88 
 
 		 212 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  38.38 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  38.38 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  37.69 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  37.69 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  37.37 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.17 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.17 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0883  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.17 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.17 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  33.17 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1893  thioredoxin domain-containing protein  33.17 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.68 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  33.17 
 
 		 723 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  31.28 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2547  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.435599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0716  DSBA oxidoreductase  35.87 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759492  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0733  DSBA oxidoreductase  35.87 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3929  DSBA oxidoreductase  34.24 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559828  normal  0.0117415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  32.69 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2418  DSBA oxidoreductase  32.42 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0353  DSBA oxidoreductase  34.07 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.824557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0837  DSBA oxidoreductase  34.07 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0809  DSBA oxidoreductase  34.07 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  32.04 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  30.93 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0747  DSBA oxidoreductase  30.62 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.340191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  29.9 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03849  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07870)  30.66 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  28.12 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  25.37 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  30.21 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  24.87 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  25.79 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  28.79 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  22.77 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  25.79 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>