135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4153 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  70.23 
 
 
229 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  73.58 
 
 
210 aa  292  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  63.86 
 
 
214 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  58.06 
 
 
216 aa  246  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  57.21 
 
 
217 aa  240  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  56.74 
 
 
217 aa  238  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  55.19 
 
 
211 aa  234  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  55.86 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  59.53 
 
 
218 aa  230  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  40.65 
 
 
212 aa  148  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  40.09 
 
 
212 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  40.09 
 
 
212 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  39.17 
 
 
212 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  38.18 
 
 
212 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  38.18 
 
 
212 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 
211 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 
211 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  35.02 
 
 
210 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  33.65 
 
 
216 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  35.55 
 
 
723 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.55 
 
 
212 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.55 
 
 
212 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0883  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.55 
 
 
212 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.55 
 
 
212 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  35.55 
 
 
212 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1893  thioredoxin domain-containing protein  35.55 
 
 
212 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.07 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0716  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759492  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0733  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2418  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
216 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3929  DSBA oxidoreductase  35.83 
 
 
212 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559828  normal  0.0117415 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0353  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 
212 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.824557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0837  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 
212 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0809  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 
212 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2547  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 
212 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.435599 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
197 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  35.57 
 
 
224 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0747  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 
208 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.340191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  30.15 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
197 aa  92  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 
196 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  33.68 
 
 
195 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 
200 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  32.64 
 
 
195 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  31.66 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03849  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07870)  28.02 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728654  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  30.15 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  33.86 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 
200 aa  79  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  26.87 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  34.03 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  30.3 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  24.2 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  27.36 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  29 
 
 
208 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  25.98 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  29.29 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  29.21 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
198 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 
201 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 
201 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  25.87 
 
 
200 aa  61.6  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  25 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  22.75 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>