147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4809 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  97.64 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  94.81 
 
 		 212 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  92.92 
 
 		 212 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  92.92 
 
 		 212 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  91.94 
 
 		 212 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  91.04 
 
 		 212 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  65.55 
 
 		 211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  65.55 
 
 		 211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2547  DSBA oxidoreductase  54 
 
 		 212 aa  218  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.435599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0733  DSBA oxidoreductase  53.5 
 
 		 212 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0716  DSBA oxidoreductase  53.5 
 
 		 212 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759492  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  51.46 
 
 		 216 aa  214  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  53.23 
 
 		 723 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3929  DSBA oxidoreductase  54.5 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559828  normal  0.0117415 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  53.23 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  53.23 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2418  DSBA oxidoreductase  49.25 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0883  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  53.23 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  53.23 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  53.23 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1893  thioredoxin domain-containing protein  53.23 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  52.24 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  49.51 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0809  DSBA oxidoreductase  52.5 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0353  DSBA oxidoreductase  52.5 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.824557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0837  DSBA oxidoreductase  52.5 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  43.2 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  44.08 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  43.62 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  39.81 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  39.81 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  37.96 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  43.23 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  40.09 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  39.59 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0747  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.340191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  37.31 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  41.43 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  34.59 
 
 		 197 aa  104  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  30.26 
 
 		 195 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  30.53 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  31.09 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  32.82 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  32.46 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  31.05 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  29.53 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  28.36 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  30.32 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  28.34 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  26.84 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  26.56 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  28.12 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  28.34 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>