143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6054 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 200 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  64.1 
 
 		 196 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  65.64 
 
 		 196 aa  269  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  60.71 
 
 		 196 aa  253  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  60.71 
 
 		 197 aa  248  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  58.46 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  58.67 
 
 		 204 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  58.16 
 
 		 204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  58.16 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  56.63 
 
 		 197 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  55.84 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  54.31 
 
 		 195 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  47.21 
 
 		 197 aa  198  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  41.58 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 		 200 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  39.27 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  38.58 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  39.79 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  37 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  39.11 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  39.27 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  37.93 
 
 		 201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  37.24 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  39.8 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  39.59 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  36.7 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  35.53 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  35.03 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  35.53 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  34.9 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  35.16 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  33 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  34.92 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 198 aa  111  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  34.5 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  30.98 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  30.98 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  32.45 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  36.98 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  29.85 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 232 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 195 aa  87.8  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  31.55 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03849  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07870)  29.65 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  31.41 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  32.66 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4651  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  31.34 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  30.35 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  27.86 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  31.66 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>