148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0315 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  80.3 
 
 		 203 aa  344  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  80.3 
 
 		 200 aa  337  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  78.28 
 
 		 200 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  77.78 
 
 		 200 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  68.04 
 
 		 210 aa  268  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  58.59 
 
 		 201 aa  244  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  58.76 
 
 		 200 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  55.94 
 
 		 213 aa  237  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  57.79 
 
 		 207 aa  235  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  49.75 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  49.22 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  49.23 
 
 		 197 aa  178  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  43.15 
 
 		 197 aa  157  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  40.51 
 
 		 196 aa  154  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  42.05 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  41.03 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  40.51 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  37.93 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  37.89 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  38.97 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  37.95 
 
 		 195 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 		 198 aa  98.6  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  29.23 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  30.35 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 		 224 aa  91.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  29.9 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  28.87 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 201 aa  84.7  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  31.44 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  30.93 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4651  DSBA oxidoreductase  38.22 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  27.69 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  33.84 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  29.74 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  27.64 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  30.15 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03849  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07870)  29.86 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  26.5 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  25 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  26.56 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  23.98 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  29.51 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  28.96 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  25.13 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  28.71 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  28.96 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  26.18 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  23.68 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  25.27 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  34.03 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>