142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4818 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 208 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  73.53 
 
 		 207 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  72.55 
 
 		 207 aa  307  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  72.55 
 
 		 207 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  67 
 
 		 207 aa  289  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  53.5 
 
 		 214 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  53.2 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  46.31 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  41.84 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  43.78 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  41.29 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  40.2 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  37.95 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  39.6 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  39.81 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  37.81 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  38.83 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  37.76 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  37.2 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  36.08 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  28.22 
 
 		 201 aa  94.7  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 203 aa  87.8  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  29.06 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 197 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  26 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  27 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  24.24 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  22.34 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  23.23 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  23.38 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  26.11 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  22.89 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  22.73 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  22.8 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  25.37 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  23.62 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  25.87 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  22.84 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  23.86 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  26.56 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  24.6 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  24.5 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  23.68 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  26.84 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  24.06 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  25.79 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  25.65 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  23.71 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>