157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0240 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  75.88 
 
 
201 aa  299  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  69.65 
 
 
201 aa  288  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  68.34 
 
 
199 aa  277  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  59.9 
 
 
201 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  55.45 
 
 
201 aa  217  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  44.97 
 
 
204 aa  158  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  40.7 
 
 
198 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  43.56 
 
 
207 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  41.55 
 
 
207 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  42.08 
 
 
207 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  41.09 
 
 
209 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  42.57 
 
 
207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  43.08 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  39.3 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  39.6 
 
 
208 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  39.51 
 
 
219 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  42.56 
 
 
199 aa  134  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  42.05 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  41.36 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  42.56 
 
 
218 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  41.41 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  41.33 
 
 
199 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 
197 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  36.63 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  38.46 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  35.5 
 
 
195 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  36.18 
 
 
196 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 
196 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  35 
 
 
195 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
195 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 
204 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  32 
 
 
197 aa  101  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 
198 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 
197 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  31.19 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 
201 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 
219 aa  94.4  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  30.35 
 
 
219 aa  92  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  32.02 
 
 
198 aa  92  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 
201 aa  89  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  34.65 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  35.47 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 
198 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  31.4 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  31.4 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  27.69 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  31.12 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  32.82 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  32.8 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  32.66 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  25.63 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  29.02 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  27.54 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  24.76 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  23.98 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  23.76 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 
385 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 
203 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 
208 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 
208 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  27.8 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>