118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5568 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  63.13 
 
 
198 aa  269  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  36.5 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 
201 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 
218 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
201 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 
218 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
207 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 
201 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  31 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  33 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 
197 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
198 aa  91.3  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  34 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  29.44 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 
201 aa  85.5  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  29.44 
 
 
195 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  30.24 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  31.34 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.146689 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  30.2 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  26.09 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  25.74 
 
 
196 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  30.65 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  26 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  26 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  25.5 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  26.6 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  25.71 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  25.37 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  26.7 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 
200 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  34.82 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  24 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  26.73 
 
 
208 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  23 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  25.49 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0361  DSBA oxidoreductase  29.32 
 
 
219 aa  52  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.843248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  24.63 
 
 
200 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
199 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  26.32 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2081  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  31.11 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  25 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  23.37 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  27.34 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  22.95 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  22.51 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  24.5 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 
218 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  23.37 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  23.37 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  23.62 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 
219 aa  48.5  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  23.37 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  22.44 
 
 
221 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>