58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2081 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2081  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2676  DSBA oxidoreductase  55.56 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1673  DSBA oxidoreductase  53.52 
 
 		 215 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1203  DSBA oxidoreductase  56.07 
 
 		 217 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2300  DSBA oxidoreductase  52.09 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.609193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2425  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.84 
 
 		 436 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  26.89 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5538  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 441 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0197902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1112  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  28.36 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  25.73 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  26.05 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  25.47 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0981  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 441 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  24.29 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  25.58 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  26.57 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  24.66 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  24.31 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  27.27 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  26.73 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  24.52 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  29.41 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  28.71 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  23.79 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00950  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  23.27 
 
 		 207 aa  42  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  25.36 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  25.36 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  25.12 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  23.67 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>