84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0168 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 385 aa  766    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0981  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5538  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 441 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0197902  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2425  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.04 
 
 		 436 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1112  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788647  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 		 201 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 201 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  30 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  32.51 
 
 		 208 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2081  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2676  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  25.25 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 206 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2300  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.609193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  29.02 
 
 		 195 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  29.76 
 
 		 201 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1203  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 204 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  27.89 
 
 		 204 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 195 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  25.39 
 
 		 206 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1673  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 		 215 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 		 207 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  28.5 
 
 		 195 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 208 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  27.66 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 218 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  29.13 
 
 		 204 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  25.39 
 
 		 206 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  26.13 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2789  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  27.89 
 
 		 199 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 203 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  30.15 
 
 		 237 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 201 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  25.54 
 
 		 212 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  25.42 
 
 		 212 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 		 198 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  26.02 
 
 		 201 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 		 218 aa  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  26.02 
 
 		 201 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 210 aa  49.7  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  27.68 
 
 		 212 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  24.23 
 
 		 204 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  23 
 
 		 219 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 196 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 		 203 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  24.02 
 
 		 201 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 208 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 		 204 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  26.4 
 
 		 201 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  23.15 
 
 		 211 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  26.5 
 
 		 197 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  23.15 
 
 		 211 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  25.95 
 
 		 216 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  22.61 
 
 		 201 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 		 201 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00950  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  22.29 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  24.29 
 
 		 212 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4964  hypothetical protein  36.46 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 		 197 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 		 209 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 218 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 219 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 		 204 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 		 198 aa  43.1  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>