64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5538 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5538  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 441 aa  887    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0197902  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2425  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.96 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0981  DSBA oxidoreductase  38.6 
 
 		 441 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1112  DSBA oxidoreductase  32.19 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  41.06 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  30.15 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1203  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2081  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 215 aa  62  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2300  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.609193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  24.48 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  26.87 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  36.14 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 207 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 218 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  25.52 
 
 		 204 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 		 204 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  23.23 
 
 		 197 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  22.77 
 
 		 201 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  25.62 
 
 		 201 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.41 
 
 		 212 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  24.02 
 
 		 204 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  24.63 
 
 		 201 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2676  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 225 aa  51.2  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 197 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  26.67 
 
 		 201 aa  49.7  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 		 200 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 201 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 201 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  23.59 
 
 		 196 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 201 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 204 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  32.93 
 
 		 723 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  25.74 
 
 		 201 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.27 
 
 		 212 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  21.94 
 
 		 207 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1893  thioredoxin domain-containing protein  25.27 
 
 		 212 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389151  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  25.27 
 
 		 212 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.27 
 
 		 212 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 216 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0883  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.27 
 
 		 212 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.27 
 
 		 212 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  23.68 
 
 		 196 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  23.96 
 
 		 197 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 204 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  24.08 
 
 		 195 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  21.94 
 
 		 207 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 201 aa  47  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  21.21 
 
 		 210 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  23.9 
 
 		 207 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 		 197 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1673  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 215 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2789  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  22.51 
 
 		 219 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  21.54 
 
 		 201 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  22.77 
 
 		 203 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  22.77 
 
 		 206 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 229 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  20.92 
 
 		 198 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  22.61 
 
 		 210 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  23.04 
 
 		 201 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  23.74 
 
 		 209 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2547  DSBA oxidoreductase  22.75 
 
 		 212 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.435599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  21.88 
 
 		 197 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  21.51 
 
 		 201 aa  43.1  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>