57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1203 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1203  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2081  DSBA oxidoreductase  56.07 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1673  DSBA oxidoreductase  53.24 
 
 		 215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2676  DSBA oxidoreductase  51.17 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2300  DSBA oxidoreductase  46.26 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.609193 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1112  DSBA oxidoreductase  31.66 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0981  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5538  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 441 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0197902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2425  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.92 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  26.51 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  26.7 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  28.31 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  27.83 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  26.24 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  25.74 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  24.41 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  24.41 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  25.74 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  23.94 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  24.64 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  24.65 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  24.54 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  24.54 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  23.22 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  25.47 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  24.75 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  25.85 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  25.47 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  24.27 
 
 		 197 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>