166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2477 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 206 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  89.81 
 
 		 206 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  89.11 
 
 		 210 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  78.87 
 
 		 206 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  74.75 
 
 		 200 aa  321  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  70.59 
 
 		 201 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  66.18 
 
 		 201 aa  293  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  65.37 
 
 		 203 aa  284  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  56.57 
 
 		 218 aa  231  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  45 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  38.19 
 
 		 195 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  37.69 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  37.06 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  32.49 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  35.53 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  35.03 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  36.04 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  32.31 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  31 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  31.79 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  33.5 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  31.5 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  32.11 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  32.11 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  32.11 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  31.44 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 200 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  30.93 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  27.86 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  28.06 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  26 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  24.75 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  29.02 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  24.75 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  24.75 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  26.5 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  27.8 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  22.51 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  25.37 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  25.87 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  22.55 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  22.16 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  26.21 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  20.49 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  22.06 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  25.24 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>