140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0744 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  100 
 
 
201 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  69.27 
 
 
212 aa  292  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  66.33 
 
 
212 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  67.02 
 
 
232 aa  271  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  64.77 
 
 
232 aa  268  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  58.16 
 
 
223 aa  241  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  56.78 
 
 
202 aa  232  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  50 
 
 
208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  48.45 
 
 
208 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  45.74 
 
 
195 aa  178  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  48.44 
 
 
208 aa  177  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  48.44 
 
 
208 aa  177  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  47.92 
 
 
208 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  43.59 
 
 
203 aa  168  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  47.45 
 
 
208 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  43.43 
 
 
204 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  35.57 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  36.17 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 
219 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 
204 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  34.21 
 
 
195 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  34.21 
 
 
195 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 
204 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  34.02 
 
 
205 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
219 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 
204 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  33.69 
 
 
197 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  31.38 
 
 
201 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  30.32 
 
 
201 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  31.94 
 
 
199 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
196 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
201 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
195 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  31.77 
 
 
199 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  32.81 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  30.96 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
218 aa  92.8  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 
203 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  32.81 
 
 
200 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 
210 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 
218 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  31.18 
 
 
202 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 
213 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  29.9 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
198 aa  85.5  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 
200 aa  84.3  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  30.35 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  27.89 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  26.2 
 
 
198 aa  72  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  27 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  23.53 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4651  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 
202 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  28.91 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 
218 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  26.04 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  24.62 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  26.02 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  25.51 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  25.4 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  26.73 
 
 
209 aa  58.2  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 
204 aa  58.2  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  23.44 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  26.26 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  25.38 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  25.89 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  23.98 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  24.46 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
216 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  26.84 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>