134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5151 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  68.04 
 
 		 201 aa  268  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  68.59 
 
 		 203 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  66.49 
 
 		 200 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  66.49 
 
 		 200 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  64.4 
 
 		 200 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  61.31 
 
 		 200 aa  251  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  56.63 
 
 		 207 aa  234  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  56.12 
 
 		 201 aa  227  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  53.54 
 
 		 213 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  51.28 
 
 		 200 aa  208  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  50.25 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  45.5 
 
 		 197 aa  175  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  42.79 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  39.5 
 
 		 196 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  39.39 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  38.89 
 
 		 195 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  37 
 
 		 200 aa  144  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  40.5 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  41.18 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  37.37 
 
 		 195 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  38 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 196 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  34.85 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  32.32 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  30.96 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  34.03 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  32.81 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  30.65 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  29.23 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  29.85 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 198 aa  85.1  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  25.35 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  25.87 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  25.74 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  27.05 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03849  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07870)  32.52 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  28.79 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  29 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  28 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  25.87 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  21.35 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  26.73 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  23.76 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  25.98 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4651  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  23.88 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  24.63 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  29.33 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  26.13 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  23.56 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>