169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0567 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  96.48 
 
 		 199 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  70.2 
 
 		 218 aa  290  8e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  38.27 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  43.43 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  38.97 
 
 		 201 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  38.31 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  37.95 
 
 		 201 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  39.79 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  39.29 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  34.87 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  40.72 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  37.76 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  41.92 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  32.31 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  35.26 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  36.17 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  32.31 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  30.98 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  36.6 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  36.6 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  35.03 
 
 		 195 aa  101  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  32.81 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  31.77 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  32.29 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  36.55 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  31.09 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  31.41 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  29.76 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  29.08 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  31.09 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  27.89 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  27.69 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  22.7 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  25.37 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  26.96 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4651  DSBA oxidoreductase  35.83 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  25.39 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  26.42 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  24.37 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  28.43 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>