123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3822 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  64.43 
 
 		 204 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  58.79 
 
 		 199 aa  241  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  61.73 
 
 		 199 aa  227  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  43 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  43 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  40.82 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  47.31 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  41.92 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  39.11 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  41.33 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  39 
 
 		 209 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  42.23 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  38.97 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  41.09 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  38 
 
 		 208 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  39.5 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  40.72 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  39.09 
 
 		 207 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  37.13 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  38.78 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  34.76 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  33.84 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 		 218 aa  98.2  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  35.61 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  34.67 
 
 		 195 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  34.67 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 		 196 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  27.09 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  31.53 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  29.17 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  26.26 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  24.63 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  25.37 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  31.66 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  22.77 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  33.84 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  32.02 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  27.55 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  26.4 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  31.12 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  28.5 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  32.49 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  33 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  28.64 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  26.6 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  26.04 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  26.04 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  26.84 
 
 		 232 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  26.18 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>