138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5257 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
213 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  60.3 
 
 
200 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  60.2 
 
 
201 aa  238  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  55.94 
 
 
201 aa  237  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  57.79 
 
 
200 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  56.28 
 
 
203 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  59.3 
 
 
200 aa  235  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  56.28 
 
 
200 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  54.55 
 
 
207 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  54.82 
 
 
200 aa  223  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  53.54 
 
 
210 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  51.49 
 
 
201 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  45.27 
 
 
197 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  44.95 
 
 
197 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  44.95 
 
 
196 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  42.64 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  41.71 
 
 
195 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  42.42 
 
 
197 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  42.21 
 
 
204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 
204 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  38.78 
 
 
195 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  43.56 
 
 
197 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  40.78 
 
 
204 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  39.59 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  39.2 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  38.69 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  34.98 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 
218 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 
203 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
198 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  34.65 
 
 
212 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  31.53 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
206 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  32.85 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  35.23 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  31.86 
 
 
200 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 
232 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 
201 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  33.5 
 
 
202 aa  91.3  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  32.69 
 
 
224 aa  91.3  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 
232 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 
202 aa  88.6  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  31.07 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0481495 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03849  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07870)  30.1 
 
 
220 aa  86.3  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728654  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  27.05 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 
204 aa  82  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  30.33 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  29.27 
 
 
207 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  31.55 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  27 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  35.23 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  33 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  29.59 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  30 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  32 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  29.06 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  32.81 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>