155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0123 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 201 aa  413  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  99.5 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  91.04 
 
 		 201 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  72 
 
 		 219 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  70 
 
 		 219 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  50.5 
 
 		 201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  43.59 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  43.94 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  43.72 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  37.95 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  37.95 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  37.57 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  38.74 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  35.53 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  39.09 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  36.13 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  36.13 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  36.79 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  35.08 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  38.3 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  35.71 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  36.5 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  36.32 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  35.71 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  34 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  34 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  31.66 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  32.18 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 195 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  31.38 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  31.38 
 
 		 232 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  32.18 
 
 		 201 aa  94.7  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  31 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  32.83 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  29.85 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  27.23 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  25.74 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  26.46 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  29.23 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  28.08 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4651  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  27.64 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  26.73 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  29.23 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  26.76 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  28.79 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  29.29 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>