125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1456 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  55.17 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  55.61 
 
 		 207 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  54.41 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  54.23 
 
 		 207 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  53.5 
 
 		 208 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  56.28 
 
 		 204 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  45.45 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  46.46 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  42.71 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  39.38 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  41.58 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  40.39 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  43.08 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  40.5 
 
 		 199 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  41.5 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  35.1 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  39.49 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  36.74 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  39.41 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  40.61 
 
 		 199 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  37.37 
 
 		 204 aa  127  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  40.38 
 
 		 199 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  33.84 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  33 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  32.84 
 
 		 195 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 		 198 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  30.15 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  28.1 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  22.44 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  23.41 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  25.94 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  32.68 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  22.5 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  27.69 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  23.27 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  23.27 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  24.74 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  27.69 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  23.3 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  27.8 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  22.34 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  24.61 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  23.74 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  30.05 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  24.08 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  28.14 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  24.21 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  22.68 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  21.29 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  29.06 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>