137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0898 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  43.28 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  44.04 
 
 		 201 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  40.87 
 
 		 204 aa  138  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  39.51 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  38.54 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  38.42 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  36.95 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  36.74 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  35.47 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 		 209 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  36.5 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  38.54 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  42.23 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  36.63 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  36.5 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  36.76 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  32.69 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  31.1 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  32.71 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  26.94 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  29.06 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  23.96 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  25.94 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  26.05 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  25.35 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  26.21 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2676  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  24.11 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  36.96 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  28.5 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  24.77 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  27.04 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  20.93 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  25.38 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  22.73 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  25.58 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2300  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.609193 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  33.81 
 
 		 723 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03849  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07870)  24.77 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.81 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.81 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.81 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  39.53 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  39.53 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  23.19 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0883  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.81 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.81 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  32.81 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1893  thioredoxin domain-containing protein  32.81 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2547  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.435599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  23.53 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  23.53 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  25.49 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  23.53 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  21.36 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>