57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2300 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2300  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.609193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2676  DSBA oxidoreductase  52.31 
 
 		 225 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2081  DSBA oxidoreductase  52.09 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1673  DSBA oxidoreductase  52.58 
 
 		 215 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1203  DSBA oxidoreductase  44.95 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  27.05 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2425  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.32 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  25.73 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5538  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0197902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  30.09 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  28.91 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  27.05 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  26.85 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0981  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 441 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  28.08 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00950  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  24.5 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  24.15 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  26.57 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  27.1 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  26.61 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1112  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 		 435 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788647  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  24.53 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  27.19 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  24.76 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  25.35 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  29.05 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  25.24 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  26.15 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 		 200 aa  42  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>