43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1112 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1112  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 435 aa  906    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0981  DSBA oxidoreductase  43.44 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2425  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  40.05 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5538  DSBA oxidoreductase  32.19 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0197902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 385 aa  179  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1203  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2081  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 		 215 aa  59.7  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  23.66 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 198 aa  53.9  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1673  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 215 aa  53.9  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2676  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 		 225 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 201 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  23.08 
 
 		 201 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  28.23 
 
 		 216 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  27.42 
 
 		 198 aa  50.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 202 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  23.76 
 
 		 216 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 196 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 197 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  20.71 
 
 		 201 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 		 207 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  23.78 
 
 		 197 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  22.17 
 
 		 196 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  24.75 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  23.83 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2300  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 		 216 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.609193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  23.2 
 
 		 216 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  22.8 
 
 		 207 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  23.56 
 
 		 204 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  21.39 
 
 		 201 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 212 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 209 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  22.8 
 
 		 211 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  22.8 
 
 		 211 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  23.32 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 		 212 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  23.35 
 
 		 204 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  22.4 
 
 		 197 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 		 212 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  25.13 
 
 		 195 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  23.53 
 
 		 206 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  23.36 
 
 		 220 aa  43.1  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>