45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2676 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2676  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
225 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1673  DSBA oxidoreductase  61.03 
 
 
215 aa  256  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2081  DSBA oxidoreductase  55.56 
 
 
215 aa  235  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2300  DSBA oxidoreductase  52.31 
 
 
216 aa  228  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.609193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1203  DSBA oxidoreductase  50 
 
 
217 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2425  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.62 
 
 
436 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
385 aa  58.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 
201 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  24.41 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1112  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 
435 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 
207 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 
207 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5538  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 
441 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0197902  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 
197 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  22.97 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  25.36 
 
 
201 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  25.59 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0981  DSBA oxidoreductase  25.48 
 
 
441 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 
204 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  22.94 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  23.39 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  24.77 
 
 
201 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  23.74 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  24.3 
 
 
201 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  29.91 
 
 
208 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 
204 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  24.27 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  24.39 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  27.35 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2789  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  26.99 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.243641 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 
216 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
209 aa  42  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>